Question

我是R的新手，现在正在运行geeglm()。但是它带来了一些问题：

我已经检查了我的数据，没有NA，但仍然出现warning message: In diff(as.numeric(id)) : NAs introduced by coercio.
我读到GEE软件包中没有负二项式族。有人可以和我讨论吗？

这些是我的因素：

`Total <- as.numeric(freetick$Female + freetick$Male + freetick$Nymph + 
freetick$Larva)
Habitat <- as.factor(freetick$Habitat)
Month <- as.factor(freetick$Month)
Location <- as.factor(freetick$Location)
Pellet <- as.numeric(freetick$Pellet)`

总数是tick的总和，栖息地是三种栖息地的类型，月份是我进行调查的时间，位置是我的研究地点，每2个月重复一次，颗粒是鹿粪便颗粒组的总和。

我认为警告消息来自数字的“总计”或“颗粒”。当我读取数据时，两者都没有NA或逗号，那么此警告消息是否表示我不知道的内容？

这就是我运行GEE的方式：

`total.tick<-freetick %>%group_by(Habitat,Month, Location) 
%>%dplyr::summarise(total=sum(Total)) %>%
  complete(Month, fill = list(tick.total = NULL))
total.tick[is.na(total.tick)==T]<-0
ttgee<- geeglm(Total~ Habitat + Month + Pellet + 
Month*Habitat,id=Location,data=total.tick,
               family=poisson,corstr = "ar1")`

对于第二个问题，我使用Poisson分布，因为软件包GEE中没有负二项式族。我之所以不使用GEE而不是GLMM的原因仅仅是因为结果来自“模型无法与max | grad |收敛”我之所以胖是因为我的样本量不够。除了重复定位因素外，我的GEE值也很适合我的数据。

最后，我使用dput()复制了部分数据：

`structure(list(Location = c("牛頭", "牛口", "牛外", "觀-1", "觀-2", 
"觀-3", "觀對", "柚子湖", "溫泉", "海參", "睡美人", "孔子", "夏卡爾", 
"大白砂", "龜1", "龜2", "過前-1", "過前-2", "過前-3", "過前-4", 
"過山-1", "過山-2", "過山-3", "過山-4", "過山-5", "空-1", "空-2", 
"空-3", "空-4", "空-5", "空-6", "牛頭", "牛口", "牛外", "觀-1", 
"觀-2", "觀-3", "觀對", "柚子湖", "溫泉", "海參", "睡美人", "孔子", 
"夏卡爾", "大白砂", "龜1", "龜2", "過前-1", "過前-2", "過前-3"
), Habitat = c("草地", "草地", "草地", "草地", "草地", "草地", 
"草地", "草地", "草地", "路邊", "路邊", "路邊", "路邊", "路邊", 
"路邊", "路邊", "路邊", "路邊", "路邊", "路邊", "森林", "森林", 
"森林", "森林", "森林", "森林", "森林", "森林", "森林", "森林", 
"森林", "草地", "草地", "草地", "草地", "草地", "草地", "草地", 
"草地", "草地", "路邊", "路邊", "路邊", "路邊", "路邊", "路邊", 
"路邊", "路邊", "路邊", "路邊"), Month = c("一月", "一月", "一月", 
"一月", "一月", "一月", "一月", "一月", "一月", "一月", "一月", 
"一月", "一月", "一月", "一月", "一月", "一月", "一月", "一月", 
"一月", "一月", "一月", "一月", "一月", "一月", "一月", "一月", 
"一月", "一月", "一月", "一月", "三月", "三月", "三月", "三月", 
"三月", "三月", "三月", "三月", "三月", "三月", "三月", "三月", 
"三月", "三月", "三月", "三月", "三月", "三月", "三月"), Male = c(2L, 
0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 1L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 
0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 1L, 0L, 1L, 0L, 1L, 0L, 1L, 1L, 
2L, 0L, 1L, 1L, 0L, 0L, 2L, 0L, 7L, 0L, 0L, 0L, 1L, 0L, 0L, 1L, 
0L), Female = c(2L, 0L, 0L, 0L, 1L, 1L, 1L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 
0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 
0L, 1L, 0L, 0L, 1L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 1L, 0L, 0L, 
0L, 1L, 0L, 0L, 0L, 1L), Nymph = c(3L, 0L, 1L, 2L, 2L, 0L, 1L, 
0L, 1L, 1L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 1L, 0L, 1L, 0L, 0L, 0L, 1L, 
3L, 0L, 2L, 2L, 4L, 2L, 1L, 4L, 6L, 3L, 3L, 3L, 7L, 0L, 6L, 2L, 
2L, 0L, 15L, 10L, 0L, 13L, 22L, 6L, 2L, 1L, 7L), Larva = c(0L, 
0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 6L, 0L, 0L, 1L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 
0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 1L, 0L, 0L, 0L, 12L, 5L, 4L, 0L, 7L, 
1L, 6L, 3L, 10L, 5L, 13L, 2L, 8L, 0L, 12L, 8L, 0L, 7L, 36L, 14L, 
32L, 13L, 4L), Total = c(7L, 0L, 1L, 2L, 3L, 1L, 9L, 0L, 1L, 
2L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 1L, 0L, 1L, 0L, 0L, 0L, 1L, 4L, 0L, 
3L, 2L, 17L, 7L, 7L, 4L, 14L, 6L, 11L, 6L, 18L, 6L, 19L, 4L, 
12L, 0L, 35L, 18L, 0L, 20L, 60L, 20L, 34L, 15L, 12L), Pellet = c(0L, 
0L, 0L, 10L, 1L, 11L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 
0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 12L, 1L, 5L, 0L, 1L, 0L, 
3L, 0L, 0L, 9L, 7L, 2L, 17L, 2L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 
0L, 0L, 0L, 0L), Adult = c(4L, 0L, 0L, 0L, 1L, 1L, 2L, 0L, 0L, 
0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 0L, 
1L, 0L, 1L, 0L, 2L, 0L, 1L, 2L, 2L, 0L, 1L, 1L, 0L, 0L, 2L, 0L, 
8L, 0L, 0L, 0L, 2L, 0L, 0L, 1L, 1L)), row.names = c(NA, 50L), 
class="data.frame")`

如何解决“警告消息：在diff（as.numeric（id））中：强制引入的NA”以及有关GEE的一些问题？

0 个答案: