可能有可变长度的基因组处于灭绝状态吗?

时间:2019-08-15 11:42:19

标签: python deap

我似乎不知道如何在DEAP中拥有可变长度的基因组。

我浏览了DEAP文档,没有发现与可变长度基因组有关的任何信息。

1 个答案:

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如果在不指定n参数的情况下定义个人,则可以创建许多具有不同长度的个人。例如

from deap import base, tools, creator
import random

toolbox = base.Toolbox()

creator.create("FitnessMax", base.Fitness, weights=(1.0,))
creator.create("Individual", list, fitness=creator.FitnessMax)
toolbox.register("individual", tools.initRepeat, creator.Individual, random.random)

print(toolbox.individual(n=2))
print(toolbox.individual(n=5))

如果要创建每个个体的长度都不同的种群,可以查看Knapsack problem from the DEAP documentation。主要思想归结为以这种方式定义人口:

from deap import creator, base, tools
import random

creator.create("Fitness", base.Fitness, weights=(-1.0, 1.0))
creator.create("Individual", set, fitness=creator.Fitness)

toolbox = base.Toolbox()
toolbox.register("attr_item", random.randrange, 5)
toolbox.register("individual", tools.initRepeat, creator.Individual, 
    toolbox.attr_item, 3)
toolbox.register("population", tools.initRepeat, list, toolbox.individual)

toolbox.population(n=5)