如何在vaex交互式Jupyter bqplot plot_widget中更改点样式以使单个点更大且可见？

Question

我正在评估vaex，用于Large plot: ~20 million samples, gigabytes of data

中描述的交互式异常值选择用例

基本上，我有一些个别点是异常值，我想在图形上查看它们以手动选择它们，然后进一步检查它们。

问题在于，如果数据集的其余部分太大，则各个点将变得不可见。

如何使这些单个点可见？

例如，如果我生成一个数据集，该数据集具有10亿个点，并且在中心顶部有一个异常值：

import h5py
import numpy

size = 1000000000

with h5py.File('1b.hdf5', 'w') as f:
    x = numpy.arange(size + 1)
    x[size] =  size / 2
    f.create_dataset('x', data=x, dtype='int64')
    y = numpy.arange(size + 1) * 2
    y[size] =  3 * size / 2
    f.create_dataset('y', data=y, dtype='int64')
    z = numpy.arange(size + 1) * 4
    z[size] = -1
    f.create_dataset('z', data=z, dtype='int64')

，然后使用以下命令将其显示在Jupyter笔记本上：

import vaex
df = vaex.open('1b.hdf5')
df.plot_widget(df.x, df.y, backend='bqplot')

我在Jupyter上得到了这个

所以我看不到离群值应该在中间顶部。

但是我可以选择它，因为我知道它在哪里，并且确实会在selection=True方法上显示。只是没有显示。

在https://vaex.readthedocs.io/en/latest/tutorial.html#Smaller-datasets-/-scatter-plot上有一些示例，这些示例看起来很明显，但是我尝试将额外的参数c="red", alpha=0.5, s=4添加到plot_widget上，但没有用，可能是该后端不支持它们

也许有一种方法可以配置bqplot来更改其打印样式？

在vaex 2.0.2上进行了测试。

Answer 1

这可能是小部件的布局问题。从顶部看，我似乎被剪裁了。但是，如果缩小，则应该可以看到它。

假设您这样做了，由于vaex的plot_widget不会绘制符号（否则它将无法显示10亿个点），因此您可能看不到太多，

如果要查看低密度区域，则可能要在日志中显示（通过f ='log'，或打开左侧的抽屉并选择它）。如果在日志中显示，则其为空的区域将为-inf，将透明显示。因此，您现在应该能够更轻松地看到“异常像素”，特别是如果您降低分辨率（通过形状= 128）。

具有这两个选项：

df.plot_widget(df.x, df.y, f='log', shape=128, backend='bqplot')

输出看起来像这样：

，离群点在中心顶部清晰可见。