np.savetxt触发ValueError。为什么?

时间:2019-08-02 08:21:29

标签: python valueerror

程序中较早的时候,我计算矩阵P和K。我需要 PKP 的特征值。由于这需要一段时间(这是10000 x 10000矩阵),因此我想将结果保存到某个地方,以便即使重新启动计算机也可以轻松访问。

程序的最后两行是:

eigs=np.linalg.eig(P@K@P)
np.savetxt('eigdata.txt',eigs)

这会触发错误:

  

ValueError:无法广播来自形状(10000,10000)的输入数组   成型(10000)

最后一次删除可以消除错误,因此问题肯定出在np.savetxt上。

我该如何解决?

谢谢

2 个答案:

答案 0 :(得分:1)

np.linalg.eig输出两个np.ndarray,其中一个形状为(1000,),第二个形状为(1000,1000)。 您应该将它们保存到其他文件中,或者使用np.saveznp.savez_compressed代替:

np.savez('eigdata', *eigs)

并在以后还原它们:

w, v = np.load('eigdata.npz').values()

答案 1 :(得分:0)

使用eig中的一个简单示例:

In [332]: a = np.array([[1, 1j], [-1j, 1]]) 
     ...: w,v = np.linalg.eig(a)                                                                             

In [334]: np.savez('eig.npz', w=w, v=v)                                                                      


In [335]: d = np.load('eig.npz')                                                                             
In [336]: list(d.keys())                                                                                     
Out[336]: ['w', 'v']
In [337]: d['w']                                                                                             
Out[337]: array([2.+0.j, 0.+0.j])
In [338]: d['v']                                                                                             
Out[338]: 
array([[ 0.        +0.70710678j,  0.70710678+0.j        ],
       [ 0.70710678+0.j        , -0.        +0.70710678j]])

或者没有关键字名称:

In [339]: np.savez('eig.npz', w,v)                                                                           
In [340]: d = np.load('eig.npz')                                                                             
In [341]: list(d.keys())                                                                                     
Out[341]: ['arr_0', 'arr_1']
In [342]: d['arr_0']                                                                                         
Out[342]: array([2.+0.j, 0.+0.j])

我怀疑如果出现泡菜错误,那是因为要保存一个元组或字典之类的对象:

In [345]: np.savez('eig.npz', {'w':w, 'v':v})                                                                
In [346]: d = np.load('eig.npz')                                                                             
In [347]: list(d.keys())                                                                                     
Out[347]: ['arr_0']
In [348]: d['arr_0']                                                                                         
...
ValueError: Object arrays cannot be loaded when allow_pickle=False

最近的numpy版本对此腌制参数变得很挑剔。

或者您可以将数组保存为两个文件:

In [370]: np.save('eig_w.npy',w); np.save('eig_v.npy',v)                                                     
In [371]: np.load('eig_w.npy')                                                                               
Out[371]: array([2.+0.j, 0.+0.j])
In [372]: np.load('eig_v.npy')                                                                               
Out[372]: 
array([[ 0.        +0.70710678j,  0.70710678+0.j        ],
       [ 0.70710678+0.j        , -0.        +0.70710678j]])

===

使用:

In [373]: eigs = np.linalg.eig(a)
In [375]: np.savez('eig.npz', eigs) 
ValueError: could not broadcast input array from shape (2,2) into shape (2)

该错误是由np.array(eigs)步骤引起的。 np.save用于保存数组。给定一个元组,它将尝试将其变成数组。

保存*eigs就像上面的In [339]示例:

In [385]: np.savez('eig.npz', *eigs)                                                                         
In [386]: d = np.load('eig.npz')                                                          
In [387]: list(d.keys())                                                                                     
Out[387]: ['arr_0', 'arr_1']
In [388]: d['arr_1']                                                                                         
Out[388]: 
array([[ 0.        +0.70710678j,  0.70710678+0.j        ],
       [ 0.70710678+0.j        , -0.        +0.70710678j]])
In [389]: d['arr_0']                                                                                         
Out[389]: array([2.+0.j, 0.+0.j])