我已将iNEXT的成对的138个植被区的丰度数据格式化为成对的iNEXT火灾前和火灾后数据,方法是将我的计数数据分解为所有火灾前和火灾后样地的计数。计数是以每公顷为单位的数字,因为在火灾前和火灾后采样间隔之间地块大小不同。当我运行iNEXT并指定se = T和conf = 0.95时,我得到的置信区间非常小,当使用ggiNEXT命令绘制它们时,它们根本不显示。我写信是想知道我做错了什么,或者这些结果是否正确。
out <-iNEXT(master,q = c(0,1,2),se = T,conf = 0.95,datatype =“ abundance”)
ggiNEXT(out,type = 1,facet.var =“ order”,se = T,color.var =“ order”)+ theme_bw(base_size = 8)
out <-iNEXT(master,q = c(0,1,2),se = T,conf = 0.95,datatype =“ abundance”)
ggiNEXT(out,type = 1,facet.var =“ order”,se = T,color.var =“ order”)+ theme_bw(base_size = 8)
我希望这些配置项会更大,就像我通过Rob Colwell的EstimateS GUI软件进行这些分析时一样,在该软件中,我能够指定结果而无需将数据分解为两类物种计数(pre-vs射击后)。即,在EstimateS中,我能够使用所有图的所有图计数数据来构建稀疏度曲线和CI。这些iNEXT结果是否合理?