Question

所以我的问题是从列表img_array生成动画。上面的代码基本上用于从文件夹中获取图像，对其进行批注，然后将其保存到数组中。想知道是否有人对如何将图像数组中的图像转换为动画有任何建议。任何帮助表示赞赏！ TIA。

我尝试了FFmepg，但没有，但是似乎都不起作用。我也在OpenCV中尝试过视频刻录机，但是当我尝试打开文件时，却发现该文件类型不受支持或损坏。

import cv2
import numpy as np
import glob
import matplotlib.pyplot as plt
from skimage import io
import trackpy as tp
import pims
import pylab as pl


##########
pixel_min=23
min_mass=5000
Selector1=[1,2,3,4,5,6,7,11]
##########

frames = pims.ImageSequence('/Users/User/Desktop/eleventh_trial_2/*.tif', as_grey=True)

f1 = tp.locate(frames[0], pixel_min,minmass=min_mass)
plt.figure(1)
ax3=tp.annotate(f1,frames[0])
ax = plt.subplot()
ax.hist(f1['mass'], bins=20)
ax.set(xlabel='mass', ylabel='count');



f = tp.batch(frames[:], pixel_min, minmass=min_mass);

#f = tp.batch(frames[lower_frame:upper_frame], pixel, minmass=min_mass);
t=tp.link_df(f,10,memory=3)
##############
min_mass=8000#12000 #3000#2000 #6000#3000
pixel_min=23;
count=0
img_array = []


for filename in glob.glob('/Users/User/Desktop/eleventh_trial_2/*.tif'):
    img = cv2.imread(filename)
    height, width, layers = img.shape
    size = (width,height)
    img2 = io.imread(filename, as_gray=True)
    fig, ax = plt.subplots()
    ax.imshow(img)




    #ax=pl.text(T1[i,1]+13,T1[i,0],str(int(T1[i,9])),color="red",fontsize=18)

    T1=t.loc[t['frame']==count]
    T1=np.array(T1.sort_values(by='particle'))
    for i in Selector1:
        pl.text(T1[i,1]+13,T1[i,0],str(int(T1[i,9])),color="red",fontsize=18)
        circle2 = plt.Circle((T1[i,1], T1[i,0]), 5, color='r', fill=False)
        ax.add_artist(circle2)


count=count+1
img_array.append(fig)

ani = animation.ArtistAnimation(fig, img_array, interval=50, blit=True,repeat_delay=1000)

运行此程序时，我没有收到任何错误，但是我无法像过去那样使用OpenCV videoWriter保存动画。

Answer 1

我找到了一种解决方法，尽管它不是最有效的一种。我使用os和plt.savefig（）将图形保存在单独的目录中，然后使用ImageJ自动将按顺序编号和保存的图形转换为动画。它效率不高，但可以完成工作。我仍然愿意接受更有效的答案。谢谢

如何使用图像数组生成matplotlib动画？

1 个答案: