Question

我正在全新安装Kubuntu 19.04。我也是Python和anaconda的新手，所以我犯的错误很可能很明显。我试图在通过conda创建的虚拟环境中运行OCR程序kraken，但是当我运行任何kraken命令（kraken list kraken get 10.5281/zenodo.2577813）时，出现以下错误：

Command 'kraken' not found, but can be installed with:
sudo apt install kraken

我按照here找到的说明创建了虚拟环境：

wget https://raw.githubusercontent.com/mittagessen/kraken/master/environment.yml
conda env create -f environment.yml

然后我通过conda activate kraken进入了海妖环境，但是发现kraken list无效。我试图通过conda install --name kraken kraken重新安装kraken。当我使用conda list时，kraken被列为已安装的软件包。

我认为问题可能是由于我的.bashrc错误。在我的.bashrc中，conda创建了：

# >>> conda initialize >>>
# !! Contents within this block are managed by 'conda init' !!
__conda_setup="$('/home/USERNAME/Programming/anaconda3/bin/conda' 'shell.bash' 'hook' 2> /dev/null)"
if [ $? -eq 0 ]; then
    eval "$__conda_setup"
else
    if [ -f "/home/USERNAME/Programming/anaconda3/etc/profile.d/conda.sh" ]; then
        . "/home/USERNAME/Programming/anaconda3/etc/profile.d/conda.sh"
    else
        export PATH="/home/USERNAME/Programming/anaconda3/bin:$PATH"
    fi
fi
#unset __conda_setup
# <<< conda initialize <<<

出现错误后，我注释掉了上面的内容并将其更改为：

. /home/USERNAME/Programming/anaconda3/etc/profile.d/conda.sh
conda activate

那不能解决问题。两者都在我的.bashrc的底部。我没有尝试将它们移到顶部。

同样，在每次更改后，我尝试kraken list，但没有得到可用模型的列表，而是得到了：

Command 'kraken' not found, but can be installed with:
sudo apt install kraken

是否应该使用另一个命令在conda创建的环境中使用python程序？

另外：我可以从Ubuntu存储库安装的kraken程序似乎是对DNA进行分类的程序，而不是OCR程序。

Answer 1

我认为这个Issue对其进行了解释/总结。您必须从github master分支安装 kraken ，而不要使用 conda envs 。

简单地：

# Clone the master branch into kraken directory.
$ git clone https://github.com/mittagessen/kraken.git

# And then, Use a virtualenv or just:

$ pip3 install .

这完成了 kraken 的安装，您可以使用：

进行验证

$ kraken list
$ Retrieving model list .✓
10.5281/zenodo.2577813 (pytorch) - A generalized model for English printed text

Anaconda：尽管“ kraken”已安装在我的虚拟环境中，但未在其中运行

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