我想找到在data.table对象中赋予rowise的多个范围的重叠部分。
一个例子是:
t <- data.table(a = c(3,4,5), b = c(13,12,19))
所以我们有范围:
3-13 4-12 5-19
因此重叠范围将是:
5-12
如果附加范围为19-22,则重叠应返回NA-NA或0-0,因为没有重叠。
我找到了类似问题的解决方案,例如spatstat.utils :: intersect.ranges()。但是,这仅适用于两个向量,并且很难在data.table
中实现 DT[,.(o.l = function()[1], o.r = function()[2], by=.()]
如果可能的话,我真的很想做..
作为此示例的输出,我希望具有:
t <- data.table(a = c(3,4,5), b = c(13,12,19), o.l = c(5,5,5), o.r = c(12,12,12))
答案 0 :(得分:1)
这是一个单行示例:
library(data.table)
dt = data.table(a = c(3,4,5), b = c(13,12,19))
dt[, c("o.l", "o.r") := as.list(range(Reduce(intersect, mapply(seq, a, b, 1))))]
dt
# a b o.l o.r
# 1: 3 13 5 12
# 2: 4 12 5 12
# 3: 5 19 5 12
问题的核心是
dt = data.table(a = c(3,4,5), b = c(13,12,19))
dt[, Reduce(intersect, mapply(seq, a, b, 1))]
# [1] 5 6 7 8 9 10 11 12
答案 1 :(得分:1)
David Aurenburg的借用想法在How to flatten / merge overlapping time periods中回答,这是另一种可能的方法:
DT[, g := c(0L, cumsum(shift(a, -1L) >= cummax(b))[-.N])][,
c("ol", "or") := .(max(a), min(b)), g]
数据:
DT <- data.table(a = c(3,4,5,19,20,24), b = c(13,12,19,22,23,25))
输出:
a b g ol or
1: 3 13 0 5 12
2: 4 12 0 5 12
3: 5 19 0 5 12
4: 19 22 1 20 22
5: 20 23 1 20 22
6: 24 25 2 24 25