在R中,我想循环使用一组三个函数,而输出则需要从每个函数中保存一个与输入相关的名称。应用于一个文件时,此方法有效,但我想循环遍历300多个对象,并且该功能需要在对象中指定元素。
我试图创建对象列表和输出名称,并使用for循环为单个函数(a.ppp)进行遍历,并收到错误“ i [[“ X”]]中的错误:下标出边界”。我对for循环非常陌生,并且编码背景有限,不确定我创建的循环结构是否正确。我尝试了多种选择,包括遍历数据框或基于其他一些堆栈溢出问题的嵌套循环。
一些玩具数据,代表我的设置。我有数据框,例如。 a-g
a <- data.frame(X = c(1, 2, 3),
Y = c(3,2,1),
Z = c(4,5,6),
M = c('A', 'B', 'C'))
我想遍历以下三个功能。
library(spatstat)
a.ppp = ppp(a$X,a$Y,c(0,3),c(0,3),marks = a$M)
a.nnd = nndist(a.ppp,by=a.ppp$marks)
a.append = cbind(a,a.nnd)
我的尝试已经包括
listObj = c("a","b","c","d","e","f","g")
list.ppp = c("a.ppp","b.ppp","c.ppp","d.ppp","e.ppp","f.ppp","g.ppp")
for (i in listObj) {
for (j in list.ppp) {
j=ppp(i[["X"]],i[["Y"]],c(0,12),c(0,12),marks=i[["M"]])
}
}
我收到了错误:
#Error in i[["X"]] : subscript out of bounds
我的预期结果将是.ppp和.append输出到g到
以为我会跟进,基于乔兰的极有帮助的评论。我已经通过修改他提供的代码解决了这个问题。我使用的代码如下
library(spatstat)
a <- data.frame(X = c(1, 2, 3),
Y = c(3,2,1),
Z = c(4,5,6),
M = c('A', 'B', 'C'))
#Create a list of all the vectors in the environment - Not an ideal method but
suitable for the case
dfs= mget(ls())
#Create empty lists to be populated during the loop
dfs_ppp = list()
dfs_nnd = list()
dfs_final= list()
for (i in seq_along(dfs)){
dfs_ppp[[i]] <- ppp(dfs[[i]]$X,dfs[[i]]$Y,c(-1,14),c(-1,14),marks = dfs[[i]]$M)
dfs_nnd[[i]] = nndist(dfs_ppp[[i]],by=dfs_ppp[[i]]$marks)
dfs_final[[i]] = cbind(dfs[[i]],dfs_nnd[[i]])
}
答案 0 :(得分:2)
尝试更多类似的方法:
library(spatstat)
a <- data.frame(X = c(1, 2, 3),
Y = c(3,2,1),
Z = c(4,5,6),
M = c('A', 'B', 'C'))
# Put your data frames (a, b, c, etc.) in a list
dfs <- list(x = a,b = a,z = a)
for (i in seq_along(dfs)){
ppp_obj <- ppp(dfs[[i]]$X,dfs[[i]]$Y,c(0,3),c(0,3),marks = dfs[[i]]$M)
nnd_obj = nndist(ppp_obj,by=ppp_obj$marks)
dfs[[i]]$nnd <- nnd_obj
}