有没有一种方法可以在R中创建一个热图,使每一列都有自己的比例尺?

时间:2019-07-09 14:38:05

标签: r dataframe matrix heatmap

我正在尝试制作一个热图,其中每一列都有自己的矩阵比例,以使每一列中的颜色不受其他列的值的影响。 但是,据我所知,没有哪个主要软件包提供允许我执行此操作的选项。

我正在使用此矩阵:

structure(c(37525.6, 38150.7777777778, 54772.3, 76581.6, 89016.8888888889, 
132229.2, 47912.2222222222, 57342.2, 61666.6, 2071694.44444444, 
4640000, 3397239.5, 310529.6, 433809.7, 437263.8, 23828.1, 33041.3, 
47197.3, 19970.4, 11566.4, 14479.1), .Dim = c(3L, 7L), .Dimnames = list(
    c("Nor", "Plac", "Vaso"), c("Tnf", "Il6", "IL8", "IP10", 
    "MCP1", "GCSF", "IL10")))

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

heatmap(as.matrix(data), scale = "column")

或者,如果您希望外观更好一点:

library(dplyr)
data%>%
as.matrix()%>%
heatmap(scale = "column")

scale = "column"内置于heatmap()中,可以理解按列着色。