具有%dopar%的Foreach无法检测到用户定义的函数内的用户定义的函数

时间:2019-07-03 15:21:38

标签: r function loops foreach

我正在R中使用%dopar%运行一个foreach循环。我创建了两个用户定义的函数。我调用了一个用户定义的函数,在另一个用户定义的函数中称X,例如Y。foreach无法检测到函数X,如果我创建了包含函数Y的列表L并从L调用函数Y。

我尝试使用.export。如果我不使用包含函数X的函数Y的函数列表,则我的函数可以平稳运行。

最低工作代码如下:

# Define the function
Fun1=function(x){
  a=2*x
  b=3*x
  c=a+b
  return(c)
}
Fun2=function(x){
  a=x
  b=Fun1(x)
  c=a+b
  return(c)
}

# Create a list containing function Fun1 and Fun2
Funlist=list(Fun1, Fun2)

# Create a variable
x=1

# Run Normal Loop
for(i in 1:10){
  a=Funlist[[1]](x)
}
### Output: a=6

# Run the foreach loop
library("foreach")
library("parallel")
library("doParallel")
library("DoE.base")

registerDoParallel(7)

## Scenario 1: Run foreach loop with Fun2
df_c=foreach(seed = 1:10, .combine=rbind)%dopar%{a=Fun2(x)}
### Output: No error

## Scenario 2: Run foreach loop with Fun1 from Funlist
df_c=foreach(seed = 1:10, .combine=rbind)%dopar%{a=Funlist[[1]](x)}
### Output: No error

## Scenario 3: Run foreach loop with Fun2 from Funlist
df_c=foreach(seed = 1:10, .combine=rbind)%dopar%{a=Funlist[[2]](x)}
### Output: Error in { : task 1 failed - "could not find function "Fun1""

我希望df_c给我数据帧,输出不会有错误。

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

Reprex

SSL certificate problem: unable to get local issuer certificate

解决方案

我的首选解决方案:从不依赖于全局对象,而始终将对象作为函数的参数传递。

# Define the functions
Fun1 <- function(x) 2 * x
Fun2 <- function(x) Fun1(x + 1)

# Create a list containing functions Fun1 and Fun2
Funlist <- list(Fun1, Fun2)

# Run the foreach loop
library(doParallel)
registerDoParallel(cl <- makeCluster(2))

## Scenario 1: Run foreach loop with Fun2 
## Output: No error
foreach(x = 1:10) %dopar% Fun2(x)

## Scenario 2: Run foreach loop with Fun1 from Funlist 
## Output: No error
foreach(x = 1:10) %dopar% Funlist[[1]](x)

## Scenario 3: Run foreach loop with Fun2 from Funlist
## Output: Error in { : task 1 failed - "could not find function "Fun1""
foreach(x = 1:10) %dopar% Funlist[[2]](x)