如何安全地连接到私有mysql远程服务器并使用R获取数据?

时间:2019-07-03 12:48:46

标签: mysql r security server rmysql

我正在编写一个R程序包以提交给Bioconductor。它需要从远程mysql服务器获取4个数据库。我的问题是,关于主机服务器和mysql的用户名和密码,正确的处理方法是什么?到目前为止,我已经能够通过使用以下方法在本地创建SSH隧道来获取数据:

ssh -L 3307:localhost:3306 username@mycompany.org

然后在R中运行以下命令:

library(RMySQL)
library(dbConnect)
options(warn=-1)

getData <- function(){
  driver = dbDriver("MySQL");
  connection = dbConnect(driver, user='**', password='**', dbname='dbname', host='127.0.0.1',port=3307);
  assign("age",dbGetQuery(connection, statement= paste("select * from age")),.GlobalEnv);
  assign("biblio",dbGetQuery(connection, statement= paste("select * from biblio")),.GlobalEnv);
}

这会获取我所需的数据。因为要提交并最终发布,连接到服务器,获取数据然后关闭连接而不暴露服务器或密码的正确方法是什么?

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