Question

我正尝试在此处使用此数据集

https://mri.radiology.uiowa.edu/VHDicom/VHMCT1mm/VHMCT1mm_Head.tar.gz

测试R中的oro.dicom软件包。

我尝试代码

dcmImages <- readDICOM("C:\\Users\\Host\\Documents\\SCANS\\Head", verbose = TRUE,
                       recursive = TRUE)

然后我尝试使用extractHeader这样的功能

extractHeader(dcmImages$hdr, string="InstitutionName")

，我得到了一堆NA。但是，我可以清楚地看到何时运行此

dcmImages$hdr

我可以在控制台中看到机构名称被列为国家医学图书馆。是什么原因导致差异？

更新：最终，下面的答案开始起作用，但以前却没有，我不确定为什么。我在Windows 10操作系统上，我将R从3.5.3更新到3.6，然后它开始工作，但是运行signed = FALSE' is only valid for integers of sizes 1 and 2'函数时，此错误表示readDICOM仍然存在。但是，我现在从标题而不是NA s

获得输出

Answer 1

尝试：

library(oro.dicom)
dcmImages <- readDICOM("/<my path>/Head", verbose = TRUE, recursive = TRUE)
extractHeader(dcmImages$hdr, string="InstitutionName", numeric=FALSE)

（数字的默认值为TRUE，当值为TRUE时，值将转换为数字。）

R> extractHeader(dcmImages$hdr, string="InstitutionName", numeric=FALSE)
  [1] "National Library of Medicine" "National Library of Medicine" "National Library of Medicine"
  [4] "National Library of Medicine" "National Library of Medicine" "National Library of Medicine"
  [7] "National Library of Medicine" "National Library of Medicine" "National Library of Medicine"
 [10] "National Library of Medicine" "National Library of Medicine" "National Library of Medicine"

在R中提取dicom标头

1 个答案: