Question

我想用R制作图形，我设法用excel制作了图形。它是一个条形图，在x轴上具有种类，在y轴上具有观测值的对数。我目前在R中的数据结构不适合（我认为）制作该图，但我不知道如何（以一种聪明的方式）更改它。

除其他外，我还有一列“ camera_site”（站点1，site2 ..），“ species”（物种，agouti，paca ..），“ count”（1、2 ..），其中包含约50.000个观测值。

我尝试制作一个数据框，其中每个物种的种类分别为“物种”（有18种）和“ log（总观测值）”（see dataframe），但是我只能制作一个点图。

这就是我希望图形显示的样子： desired graph made in excel

Answer 1

从我的屏幕截图中可以看出，您的数据似乎格式正确。假设您的data.frame被称为df，则需要得到如下图形的最小代码量如下：

ggplot(df, aes(VRM_species, log_obs_count_vrm)) +
  geom_col()

许多人凭直觉尝试geom_bar()，但是geom_col()等同于geom_bar(stat = "identity")，如果您已经预先计算了观测值并且不需要ggplot进行计数，就可以使用它为了你。但是您可以通过添加一些内容来更好地装饰地块：

ggplot(df, aes(VRM_species, log_obs_count_vrm)) +
  geom_col() +
  scale_x_discrete(name = "Species") +
  scale_y_continuous(name = expression("Log"[10]*" Observations"),
                     expand = c(0,0,0.1,0)) +
  theme(axis.text.x = element_text(angle = 90))

当然，您可以根据需要自定义主题。

Groetjes

更改数据结构以在ggplot中创建正确的条形图

1 个答案: