我想绘制一个如图2所示的图,但是我不能绘制每种栖息地类型的趋势线,而只能绘制一条普通线。
有人知道我该写哪个命令吗?
此外,我还要指定y轴的比例(0,0.5,1,1.5 ...)。
library(ggplot2)
pd <- position_dodge(0.1)
ggplot(dados, aes(x=sp, y=abund, colour=habitat, group = 1)) +
geom_errorbar(aes(ymin=abund-dv, ymax=abund+dv), colour="black", width=.1, position=pd) +
geom_point(position=pd, size=4)+
geom_smooth(method = "lm", aes(fill=habitat))+
scale_fill_brewer(palette="Dark2") +
scale_colour_brewer(palette="Dark2")+
theme_bw()
sp body_mass habitat abund dv
AAOtol_cras 1206.61 FO -0.021666667 -0.010833333
ABMiop_tal 1248.86 FO -0.021666667 -0.010833333
ACCLep_cap 1500 FO -0.041666667 -0.102062073
ADGenet_gen 1756.17 FO -0.047619048 -0.162590417
BAThry_swin 4000 FO -0.382978723 -0.28152599
BDPhil_mont 6000 FO -0.725806452 -0.377581583
CALept_serv 11999.96 FO -0.433333333 -0.287270381
AAOtol_cras 1206.61 S -0.021666667 -0.010833333
ABMiop_tal 1248.86 S -0.021666667 -0.010833333
ACCLep_cap 1500 S -0.047619048 -0.109108945
ADGenet_gen 1756.17 S -0.236842105 -0.118421053
BAThry_swin 4000 S -0.475 -0.29930475
BDPhil_mont 6000 S -0.944444444 -0.446325385
CALept_serv 11999.96 S -0.590909091 -0.311003287
当前图:
所需图:
答案 0 :(得分:1)
您需要将group
中的aes()
与变量habitat
一起使用,以便将其也传递到geom_smooth
。
library(ggplot2)
ggplot(dados, aes(x=sp, y=abund, colour=habitat, group = habitat)) +
geom_errorbar(aes(ymin=abund-dv, ymax=abund+dv),
colour="black", width=.1, position=position_dodge(0.1)) +
geom_point(position=position_dodge(0.1), size=4) +
geom_smooth(method = "lm", aes(color=habitat)) +
scale_fill_brewer(palette="Dark2") +
scale_colour_brewer(palette="Dark2") +
theme_bw()
您可以在se=FALSE
中使用geom_smooth
来消除灰色置信区间,也可以使用fill
代替color
或与dados <- read.table(text="sp body_mass habitat abund dv
AAOtol_cras 1206.61 FO -0.021666667 -0.010833333
ABMiop_tal 1248.86 FO -0.021666667 -0.010833333
ACCLep_cap 1500 FO -0.041666667 -0.102062073
ADGenet_gen 1756.17 FO -0.047619048 -0.162590417
BAThry_swin 4000 FO -0.382978723 -0.28152599
BDPhil_mont 6000 FO -0.725806452 -0.377581583
CALept_serv 11999.96 FO -0.433333333 -0.287270381
AAOtol_cras 1206.61 S -0.021666667 -0.010833333
ABMiop_tal 1248.86 S -0.021666667 -0.010833333
ACCLep_cap 1500 S -0.047619048 -0.109108945
ADGenet_gen 1756.17 S -0.236842105 -0.118421053
BAThry_swin 4000 S -0.475 -0.29930475
BDPhil_mont 6000 S -0.944444444 -0.446325385
CALept_serv 11999.96 S -0.590909091 -0.311003287", header=T)
来获得相同的颜色点数。
数据:
[Manufacturer]
"Company Name" = DDInstallSectionName, architecture
[DDInstallSectionName.architecture]
"Driver Display Name" = Name_Of_Install_Section, HardwareId