我正在尝试使用ggpubr和ggplot2在我的箱线图中绘制p值。 我有多个因素。
这是我当前的代码和情节:
ggplot(dat.czm.annot.otu,aes(x=Antibiotics,y=counts,fill=Diet))+geom_boxplot(alpha=0.8)+
geom_point(aes(fill=Diet,color=Time),size = 3, shape = 21,position = position_jitterdodge(jitter.width = 0.02,jitter.height = 0))+
stat_compare_means(method = "t.test")+
ggtitle(otu)+
# scale_x_discrete(labels= c("I+","I-","bulk soil"))+
ylab("counts")+
theme(plot.title = element_text(size = 18, face = "bold"))+
theme(axis.text=element_text(size=14),
axis.title=element_text(size=14)) +
theme(legend.text=element_text(size=14),
legend.title=element_text(size=14)) +
theme(strip.text.x = element_text(size = 14))
我看了一些使用比较列表指定的示例。但我看不到它如何适用于这两个因素。
任何帮助表示赞赏。
谢谢,