“是否有R函数来查找给定搜索词的公开ID(PMID)?

时间:2019-06-17 07:10:24

标签: r function search extract pubmed

是否存在针对给定搜索词获取准确的Pubmed ID的功能?我不一样。 R中使用不同功能(例如entrez_search)的Pubmed ID的集合。

我尝试使用entrez search和get_pubmed_ids函数,但是当我在NCBI上查询发布数据库时,搜索项的计数不匹配。

library(easyPubMed)
#working directory
wd <- "C:/Users/Admin/Desktop/test"
setwd(wd)
pubmed_query_string <- "R Language "
dami_pmids <- get_pubmed_ids(pubmed_query_string, api_key = NULL)
print(dami_pmids$Count)

[1]“ 12127” 但不是。 Pubmed数据库中的PMID总数为345。

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