Bash拆分并按同一文件中的两列排序

Question

对于我的文件，如下所示：

AABBCC    10    5    CCAABB    100
BBCCAA    4     2    AABBCC    50
CCAABB    16    8    BBCCAA    20

...我正在尝试通过将第4列与第1列匹配来对第4列和第5列进行排序。

理想情况下，它将返回：

AABBCC    10    5    AABBCC    50
BBCCAA    4     2    BBCCAA    20
CCAABB    16    8    CCAABB    100

我尝试使用排序，但是据我所知，它没有用于在文件中排序的实用程序。

任何帮助将不胜感激！

Answer 1

awk 解决方案：

awk 'NR==FNR{ a[$4]=$5; next }$1 in a{ print $1,$2,$3,$1,a[$1] }' file1 OFS="\t" file1

输出：

AABBCC  10      5       AABBCC  50
BBCCAA  4       2       BBCCAA  20
CCAABB  16      8       CCAABB  100

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您可以在最后通过管道发送到sort：... | sort

Answer 2

join -t $'\t' -o 1.1,1.2,1.3,2.1,2.2 <(cut -f1-3 file.tsv | sort -k 1,1) <(cut -f4- file.tsv | sort -k 1,1) | sort

剪切原始文件，然后在两个文件的第一个字段上合并。我们需要在-o中指定完整连接字段以保留第一列，否则join会吃掉它。

Answer 3

使用bash和GNU粘贴：

带有用于说明的临时文件：

cut -f 1-3 file | sort > file_1to3
cut -f 4-5 file | sort > file_4to5
paste -d '\t' file_1to3 file_4to5

没有临时文件：

paste -d '\t' <(cut -f 1-3 file | sort) <(cut -f 4-5 file | sort)

输出：

AABBCC  10      5       AABBCC  50
BBCCAA  4       2       BBCCAA  20
CCAABB  16      8       CCAABB  100