我正在使用Biopython的globalcc函数将单词的标准版本和方言版本对齐。不幸的是，有时对齐由于没有明显的原因而失败，并返回一个空列表。
align.globalcc(Word,Dialectal,matchfunc,gapfunctionA,gapfunctionB,gap_char=['-'])
使用“lyödään”，“lywwään”作为单词对失败，即使该程序在许多接近的变体中都按预期方式工作（例如，我对“lyödään”，“lywään”进行了测试，并返回了预期的对齐方式）。
编辑：好的，看来问题出在匹配功能上。通过使用不太严重的惩罚来对齐某些字符，globalcc返回至少一个对齐。但是我仍然对这种行为感到困惑，因为我的印象是globalcc正在对可能的对齐方式进行排序，即即使在任何情况下，即使它的得分非常低，也应该返回最佳对齐方式。