编写/格式化长r脚本的技巧？

Question

我有一个400行长的R脚本，可以执行各种数据导入和处理。这是一团糟，我想知道如何正确地组织它。我最好怎么去做？

我对R笔记本非常熟悉，但是为块添加额外的代码行（具有各种选项）会增加多余的代码。我正在寻找有关代码格式和布局的更多基本技巧。它不一定是R独有的。

Answer 1

即使多年后仍在为同一事物而苦苦挣扎的人的建议：

1. 将每个主要部分拆分为一个单独的脚本（例如，加载，整理，分析，绘图，保存）。然后，主脚本只需按顺序调用它们（使用source('/path/to/script.r')）。
2. 制作一个“制作数据”单独的脚本，该脚本读取和整理数据并将其保存为快速格式（我使用RDS）。然后，主脚本可以使用此RDS文件而不是凌乱的原始数据。
3. 我认为笔记本更适合从已经处理的数据生成报告，而不是进行处理。
4. 如果有很多重复的代码，请创建自己的函数。它们较难调试，但可以整理脚本。

Answer 2

不确定是否使用过RProjects。可能会派上用场。

遇到类似问题后，我正在使用以下方法。

1. 创建RProject

2. 在该项目文件夹中创建以下文件夹

   • Data-所有输入数据都在这里。有时会有raw和processed文件夹
   • Code-包含R个功能/代码段
   • Docs-项目的所有相关文档
   • Reports-从该项目中生成的任何报告。所有RMD，笔记本电脑都在这里。
   • Output-所有输出数据都在这里

3. 任何重复的任务都将转换为函数并转到Functions.R文件，并放置在代码目录中

4. 任何更大的函数或可以独立运行的函数（例如db连接）都作为单独的文件保存在Code文件夹中
5. 所有版本的任务处理都位于主目录中，并将获取Functions.R文件和其他所需的文件