Question

我遇到以下错误，希望能帮助您跟踪为什么会发生这种情况：

回溯（最近通话最近）：文件“ wterms_1p.py”，第16行，在从w2_integration.integrate_cf导入v ImportError：dlopen（/Users/ian/Dropbox/Frohlich/linkedcluster/w2_integration/integrate_cf.so，2）：找不到符号：__ZN9Integrate1hEddPSt7complexIdE 引用自：/Users/ian/Dropbox/Frohlich/linkedcluster/w2_integration/integrate_cf.so 预期于：平面名称空间在/Users/ian/Dropbox/Frohlich/linkedcluster/w2_integration/integrate_cf.so

在某些背景下，我的代码项目包括C ++库和一个main.cpp文件，我用它来测试这些库是否正常工作。这些是通过此Makefile编译的：

CC=mpic++ -Wl,-rpath,/Users/ian/anaconda2/lib/

all: libdblquad.so libintegrate.so w2

libdblquad.so: dblquad.cpp dblquad.h
    $(CC) -O3 -std=c++14 -fPIC dblquad.cpp -lgsl -lgslcblas -shared -o libdblquad.so -Wl,-rpath,.

libintegrate.so: coefficients.cpp integrate.cpp integrate.h arithmetic.h coefficients.h Complex.h
    $(CC) -O3 -std=c++14 -fPIC coefficients.cpp integrate.cpp -L. -ldblquad -lfaddeeva -lgsl -shared -o libintegrate.so -Wl,-rpath,.

w2: main.cpp libintegrate.so libdblquad.so
    $(CC) -O3 -std=c++14 main.cpp -L. -lintegrate -lgsl -lgslcblas -Wl,-rpath,/Users/ian/Dropbox/Frohlich/linkedcluster/w2_integration/

当我运行./a.out（生成的可执行文件）时，一切正常。但是，当我随后调用下面的Cython程序中定义的函数v时：

# cython: boundscheck=False, wraparound=False, nonecheck=False, cdivision=True, profile=True, linetrace=True
# distutils: language = c++
"""nmats.py"""

from libcpp.vector cimport vector

import numpy as np
cimport numpy as cnp

def v(k, t, n0):

tt = t.ravel()

return np.asarray(cf(k, tt, n0))

cdef extern from "integrate.h":
    void integrate_cf(double k, double* t, complex* integrated_cf, int size, double n0)

cdef complex[:] cf(double k, double[:] t, double n0):

    cdef complex[:] integrated_cf = np.ascontiguousarray(np.zeros_like(t, dtype=np.complex))

    integrate_cf(k, &t[0], &integrated_cf[0], t.size, n0)

    return integrated_cf

通过setup.py编译：

from distutils.core import setup
from distutils.extension import Extension
from Cython.Build import cythonize
import numpy
import os

os.environ["CC"] = "mpic++"
os.environ["CXX"] = "mpic++"

extensions = [
Extension("integrate_cf", ["integrate_cf.pyx"], extra_compile_args=["-O3", "-std=c++14"], extra_link_args=["-L"+os.getcwd(), "-L/usr/local/lib", "-Wl,-rpath,"+os.getcwd(), "-lintegrate", "-lgsl", "-lgslcblas"])]

ext_modules = cythonize(extensions)

setup(name="intcf", language='c++', ext_modules=ext_modules, include_dirs=[numpy.get_include()])

我收到本文顶部显示的“找不到符号”错误。有关更多信息，main.cpp（它会导致可执行的工作文件）调用Integrated_cf：

void integrate_cf(double k, double* s, Complex* val, int size, double n0)
{
    Integrate integrate(n0);

    MPI_Init(0, 0);

    for( int i = 0; i < size; i++ )
    {
        //cout << s[i] << endl;
        int status = integrate.h(k, s[i], &(val[i]));

        if( status < 0 )
            break;
    }
}

同样，如上所示，上面的Cython程序也调用了Integrated_cf。 “ c ++ filt -n _ZN9Integrate1hEddPSt7complexIdE”的输出为：

Integrate::h(double, double, std::complex<double>*)

此函数在integration.h中声明，并在integrate.cpp中定义。知道为什么我的C ++可执行文件正常工作时我的Cython程序不能工作吗？

尝试在Mac上运行Cython程序时，为什么会出现找不到符号的错误？

0 个答案: