Question

我在Linux上工作，sort命令返回的结果与预期不符。

输入文字：

$ cat input.txt
rep1_1.fq
rep1_2.fq
rep12_1.fq
rep12_2.fq

命令和输出：

$ sort input.txt
rep1_1.fq
rep12_1.fq
rep12_2.fq
rep1_2.fq


$ sort --version
sort (GNU coreutils) 8.28
Copyright (C) 2017 Free Software Foundation, Inc.
License GPLv3+: GNU GPL version 3 or later <http://gnu.org/licenses/gpl.html>.
This is free software: you are free to change and redistribute it.
There is NO WARRANTY, to the extent permitted by law.

Written by Mike Haertel and Paul Eggert.

排序后，我预计rep1_2.fq将在rep1_1.fq之后，但结果有所不同。

已解决

根据@Federico klez Culloca的建议，使用LC_ALL=C

$ LC_ALL=C sort input.txt
rep12_1.fq
rep12_2.fq
rep1_1.fq
rep1_2.fq

已编辑

使用LC_ALL=C还可以修复目录中文件的排序。

如果当前目录中有四个文件：

$ LC_ALL= ls
rep1_1.fq  rep12_1.fq  rep12_2.fq  rep1_2.fq

$ LC_ALL=C ls
rep12_1.fq  rep12_2.fq  rep1_1.fq  rep1_2.fq

Answer 1

尝试使用version-sort。从手册中：

       -V, --version-sort
          natural sort of (version) numbers within text

这是使用您的示例的输出：

$ sort -V input.txt 
rep1_1.fq
rep1_2.fq
rep12_1.fq
rep12_2.fq

linux中的sort命令无法“正确”运行

1 个答案: