如何使用NeuroML数据库API收集与给定通道模型关联的细胞模型?

时间:2019-06-08 17:13:40

标签: neuroscience neuroml-database

我想将NeuroML数据库中通道模型的子集与它们所嵌入的细胞模型相关联。我想知道是否有一种快速简便的方法来获取给定通道模型的所有关联细胞。

这是Web门户(https://neuroml-db.org/model_info?model_id=NMLCH000001)上的“第一个”渠道模型。它说它属于底部的单元模型。

我已使用https://neuroml-db.org/api/models?id=NMLCHxxxxxx收集了所有通道模型的详细信息(“类型”:“ CH”),因此我具有要查看的每个通道模型的JSON。我找不到“关联的单元格”字段。

是否存在一个带有所有相关单元NMLCLxxxxxx列表的地方?我可能会想念它。

1 个答案:

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您可以使用模型API的parents键来获取与通道模型关联的所有单元格模型。

示例

例如,truthy显示它包含在以下单元格模型中:

this channel

要从API中获取这些单元格的列表:

在渠道模型详细信息API网址中: enter image description here

在结果JSON中找到顶级parents键,其中列出了上述所有单元格模型及其一些详细信息:

https://neuroml-db.org/api/model?id=NMLCH000134