将OpenACC与已编译的C程序一起使用

Question

我试图通过在适用的for循环中插入编译指示来使用OpenACC来加速Samtools软件包。

linux86-64/19.4/bin/pgcc -acc autopar -ta=tesla config.h stats.c 

我收到以下错误消息：

stats.c:
PGC-F-0206-Can't find include file config.h (stats.c: 41)
PGC/x86-64 Linux 19.4-0: compilation aborted

我检查了一下，config.h文件与stats.c文件位于同一目录中。因此，我不确定如何解决此错误，以便我可以GPU加速samtools。

在stats.c程序中添加了编译指示后，我还尝试安装samtools，但是在加速方面我看不到差异。我还检查了运行期间是否正在使用GPU，例如，当我使用samtools sort时，似乎没有使用GPU。