Question

我想在Rcpp中列出c() 2个列表，但是我正努力获得与R中相同的结构。

这是一些简单的数据+示例：

rlist = list(a = "123")
listadd = list(typ = "fdb")
c(rlist, listadd)

这给了我这个

$a
[1] "123"

$typ
[1] "fdb"

使用Rcpp时，我仅发现push_back或多或少地执行了我想要的操作，但是结构有些不同。我还尝试根据此reference使用emplace_back，但似乎并未在Rcpp中实现。

cppFunction('
List cLists(List x, List y) {
  x.push_back(y);
  return(x);
}')

这给了我

cLists(rlist, listadd)
$a
[1] "123"

[[2]]
[[2]]$typ
[1] "fdb"

基于this question，我知道我可以使用Language("c",x,y).eval();来使用R的c()函数并获得正确的结果，但这似乎不是正确的方法。

所以我想知道如何正确连接Rcpp中的列表？

编辑：根据@Dirk的评论，我尝试创建一个新列表，并用其他列表元素填充它们，但是随后我松开了元素名称。

cppFunction('
List cLists(List x, List y) {
  int nsize = x.size(); 
  int msize = y.size(); 
  List out(nsize + msize);

  for(int i = 0; i < nsize; i++) {
    out[i] = x[i];
  }
  for(int i = 0; i < msize; i++) {
    out[nsize+i] = y[i];
  }
  return(out);
}')

输出：

cLists(rlist, listadd)
[[1]]
[1] "123"

[[2]]
[1] "fdb"

Answer 1

对您的实现而言，性能下降似乎来自将name属性复制到stl字符串向量。您可以像这样避免它：

library(Rcpp)
library(microbenchmark)
cppFunction('
List cLists(List x, List y) {
  int nsize = x.size(); 
  int msize = y.size(); 
  List out(nsize + msize);

  CharacterVector xnames = x.names();
  CharacterVector ynames = y.names();
  CharacterVector outnames(nsize + msize);
  out.attr("names") = outnames;
  for(int i = 0; i < nsize; i++) {
    out[i] = x[i];
    outnames[i] = xnames[i];
  }
  for(int i = 0; i < msize; i++) {
    out[nsize+i] = y[i];
    outnames[nsize+i] = ynames[i];
  }

  return(out);
}')

x <- as.list(runif(1e6)); names(x) <- sample(letters, 1e6, T)
y <- as.list(runif(1e6)); names(y) <- sample(letters, 1e6, T)

microbenchmark(cLists(x,y), c(x,y), times=3)
Unit: milliseconds
         expr      min       lq     mean   median       uq      max neval cld
 cLists(x, y) 31.70104 31.86375 32.09983 32.02646 32.29922 32.57198     3  a 
      c(x, y) 47.31037 53.21409 56.41159 59.11781 60.96220 62.80660     3   b

注意：通过复制到std::string，您还会丢失可能的字符编码信息，而仅使用R / Rcpp保留即可。

Answer 2

这是我想出的。输出正确，但是不幸的是，它的性能也比R版本低得多。

library(Rcpp)
cppFunction('
List cLists(List x, List y) {
  int nsize = x.size(); 
  int msize = y.size(); 
  List out(nsize + msize);

  CharacterVector xnames = x.names();
  CharacterVector ynames = y.names();

  for(int i = 0; i < nsize; i++) {
    out[i] = x[i];
  }
  for(int i = 0; i < msize; i++) {
    out[nsize+i] = y[i];
  }

  std::vector<std::string> z(x.size() + y.size());
  std::copy(xnames.begin(), xnames.end(), z.begin());
  std::copy(ynames.begin(), ynames.end(), z.begin() + x.size());

  out.attr("names") = z; 

  return(out);
}')

输出：

cLists(rlist, listadd)

$a
[1] "123"

$typ
[1] "fdb"

如何在Rcpp中串联列表

2 个答案: