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为了在Keras中使用fit_generator()
,我使用了一个生成器函数,例如 pseudocode -one:
def generator(data: np.array) -> (np.array, np.array):
"""Simple generator yielding some samples and targets"""
while True:
for batch in range(number_of_batches):
yield data[batch * length_sequence], data[(batch + 1) * length_sequence]
在Keras的fit_generator()
函数中,我想使用workers=4
和use_multiprocessing=True
-因此,我需要一个线程安全的生成器。
在类似here或here或Keras docs的stackoverflow答案中,我读到了有关为Keras.utils.Sequence()
继承这样的类的信息:
class generatorClass(Sequence):
def __init__(self, x_set, y_set, batch_size):
self.x, self.y = x_set, y_set
self.batch_size = batch_size
def __len__(self):
return int(np.ceil(len(self.x) / float(self.batch_size)))
def __getitem__(self, idx):
batch_x = self.x[idx * self.batch_size:(idx + 1) * self.batch_size]
batch_y = self.y[idx * self.batch_size:(idx + 1) * self.batch_size]
return ...
通过使用Sequences
,Keras不会使用多个工作和多重处理发出任何警告;生成器应该是线程安全的。
无论如何,由于我正在使用自定义函数,因此我偶然发现了github上提供的Omer Zohars代码,该代码允许通过添加装饰器使generator()
成为线程安全的。
代码如下:
import threading
class threadsafe_iter:
"""
Takes an iterator/generator and makes it thread-safe by
serializing call to the `next` method of given iterator/generator.
"""
def __init__(self, it):
self.it = it
self.lock = threading.Lock()
def __iter__(self):
return self
def __next__(self):
with self.lock:
return self.it.__next__()
def threadsafe_generator(f):
"""A decorator that takes a generator function and makes it thread-safe."""
def g(*a, **kw):
return threadsafe_iter(f(*a, **kw))
return g
现在我可以这样做:
@threadsafe_generator
def generator(data):
...
问题是:使用此版本的线程安全生成器Keras仍会发出警告,说明在使用workers > 1
和use_multiprocessing=True
时生成器必须是线程安全的,可以通过使用{{1 }}。
我的问题是:
Sequences
而发出此警告,还是Keras还检查生成器是否总体上是线程安全的?Sequences
版本的线程安全方法?答案 0 :(得分:1)
在对此进行研究期间,我遇到了一些信息,回答了我的问题。
1。?Keras是否仅由于生成器未继承序列而发出此警告,还是Keras还会检查生成器是否总体上是线程安全的?
来自Keras的gitRepo(training_generators.py),我在第46-52
行中发现以下内容:
use_sequence_api = is_sequence(generator)
if not use_sequence_api and use_multiprocessing and workers > 1:
warnings.warn(
UserWarning('Using a generator with `use_multiprocessing=True`'
' and multiple workers may duplicate your data.'
' Please consider using the `keras.utils.Sequence'
' class.'))
在is_sequence()
行中取自training_utils.py的624-635
的定义是:
def is_sequence(seq):
"""Determine if an object follows the Sequence API.
# Arguments
seq: a possible Sequence object
# Returns
boolean, whether the object follows the Sequence API.
"""
# TODO Dref360: Decide which pattern to follow. First needs a new TF Version.
return (getattr(seq, 'use_sequence_api', False)
or set(dir(Sequence())).issubset(set(dir(seq) + ['use_sequence_api'])))
乱码这段代码Keras仅检查传递的生成器是否为Keras序列(或者使用Keras的序列API),并且通常不检查生成器是否为线程安全。
2。是在使用我选择为线程安全的方法,还是使用Keras-docs中的generatorClass(Sequence)-version?
正如Omer Zohar在gitHub上所展示的,他的装饰器是线程安全的-我看不出为什么它不应该像Keras那样具有线程安全性(即使Keras会像1所示那样发出警告)也没有任何原因。
根据{{3}},可以将thread.Lock()
的实现视为线程安全的:
一个工厂函数,它返回一个新的原始锁对象。 一旦线程获取了它,随后尝试获取它会阻塞,直到被释放;任何线程都可以释放它。
生成器也是可腌制的,可以像这样进行测试(有关更多信息,请参见此SO-Q&A docs):
#Dump yielded data in order to check if picklable
with open("test.pickle", "wb") as outfile:
for yielded_data in generator(data):
pickle.dump(yielded_data, outfile, protocol=pickle.HIGHEST_PROTOCOL)
继续此操作,我甚至建议在扩展Keras的thread.Lock()
时实施Sequence()
,例如:
import threading
class generatorClass(Sequence):
def __init__(self, x_set, y_set, batch_size):
self.x, self.y = x_set, y_set
self.batch_size = batch_size
self.lock = threading.Lock() #Set self.lock
def __len__(self):
return int(np.ceil(len(self.x) / float(self.batch_size)))
def __getitem__(self, idx):
with self.lock: #Use self.lock
batch_x = self.x[idx * self.batch_size:(idx + 1) * self.batch_size]
batch_y = self.y[idx * self.batch_size:(idx + 1) * self.batch_size]
return ...
3。。是否还有其他方法可以使Keras处理线程安全生成器,而这与这两个示例不同?
在研究期间,我没有遇到任何其他方法。 当然,我不能100%肯定地说出来。