Question

我有一个数据文件，其中包含一个序列列表，每个序列长6个氨基酸。如下所示：

QDFRGETW
AQAVRSSS
ANGVELRD

我想基本上将此文件转换为：

QAN
DQN
FAG
RVV
GRE
....
WSD

具有一个简单的for循环和while循环。

这是我尝试过的有效方法。

i2 = ''
with open('datafile','r') as f:
    for line in f:
       i2 += line[2]

我要做的是遍历索引并将每个新字符串添加到字典中。所以我决定尝试一下。

Dict = {}
i = 0
seq = ''
with open ('datafile','r') as f:
    while i <= 7:
        for line in f:
            seq += line[i]
            Dict[i] = seq
        i += 1

但是，当我打印字典时，它仅显示，例如：{0:QAN}，而没有其他显示。如果我减小Dict[i]的缩进量，它现在具有所有键，但是具有QAN值，而不是1：DQN等...

奇怪的是，即使我输入以下代码：

seq = ''
i = 0
with open ('datafile','r') as f:
    while i <= 7:
        for line in f:
            seq += line[i]
        i += 1
    print seq

如果还返回了QAN，而不是WSD，那正是我所期望的。因此，while循环存在问题。有什么想法吗？

Answer 1

下面的代码应该可以工作。 input_file.txt是包含文本的文件。我认为，预期输出的第一行必须为QAA。

for line in zip(*open('input_file.txt').readlines()):
    print(''.join(line))

输出：

QAA
DQN
FAG
RVV
GRE
ESL
TSR
WSD

遍历具有相同长度的行的文件的每个字符串的索引，同时根据单独的索引创建每个值的新字符串

1 个答案: