我试图按字母顺序对每行的第一个元素进行排序,但是努力使它起作用。
[['^', 'G', 'A', 'T', 'T', 'A', 'C', 'A', '!']]
[['G', 'A', 'T', 'T', 'A', 'C', 'A', '!', '^']]
[['A', 'T', 'T', 'A', 'C', 'A', '!', '^', 'G']]
[['T', 'T', 'A', 'C', 'A', '!', '^', 'G', 'A']]
[['T', 'A', 'C', 'A', '!', '^', 'G', 'A', 'T']]
[['A', 'C', 'A', '!', '^', 'G', 'A', 'T', 'T']]
[['C', 'A', '!', '^', 'G', 'A', 'T', 'T', 'A']]
[['A', '!', '^', 'G', 'A', 'T', 'T', 'A', 'C']]
[['!', '^', 'G', 'A', 'T', 'T', 'A', 'C', 'A']]
尝试了排序和排序功能以及熊猫,但似乎无法使其工作
with open ('BWT_test.txt','r') as seq1:
sequence1 = seq1.read()
seq1.read()
list1 = list(sequence1)
list1.insert(0,'^')
list1.append('!')
for seq1 in range(len(list1)):
table1 = [list1[seq1:] + list1[:seq1]]
sorted(table1)
print(table1)
代码应将列表整理为:
[['A', 'C', 'A', '!', '^', 'G', 'A', 'T', 'T']]
[['A', 'T', 'T', 'A', 'C', 'A', '!', '^', 'G']]
[['A', '!', '^', 'G', 'A', 'T', 'T', 'A', 'C']]
[['C', 'A', '!', '^', 'G', 'A', 'T', 'T', 'A']]
[['G', 'A', 'T', 'T', 'A', 'C', 'A', '!', '^']]
[['T', 'A', 'C', 'A', '!', '^', 'G', 'A', 'T']]
[['T', 'T', 'A', 'C', 'A', '!', '^', 'G', 'A']]
[['^', 'G', 'A', 'T', 'T', 'A', 'C', 'A', '!']]
[['!', '^', 'G', 'A', 'T', 'T', 'A', 'C', 'A']]
答案 0 :(得分:3)
sorted(data, key=lambda x: x[0])
或者...
from operator import itemgetter
sort = sorted(data, key=itemgetter(0))
将循环更改为此:
rotations = []
for seq1 in range(len(list1)):
table1 = list1[seq1:] + list1[:seq1]
rotations.append(table1)
rotations = sorted(rotations, key=lambda x: (x[0] not in string.ascii_letters, x[0]))
print([x[-1] for x in rotations])