我正在尝试对使用lmer
获得的混合效果模型进行简单的斜率分析。
该模型类似于以下内容:
data(Orthodont,package="nlme")
mod <- lme4::lmer(distance ~ age*Sex + (1|Subject), data=Orthodont)
当尝试使用软件包sim_slopes
中的函数interactions
进行简单的斜率分析时,我得到以下错误消息。
interactions::sim_slopes(model=mod, pred=age, modx=Sex)
错误:所请求的列之一不存在。
回溯:
1.互动:: sim_slopes(model = mod,pred = age,modx = Sex)
5. jtools :::: summ.merMod(...)
6. jtools ::: create_table(...)
另外:警告消息:
Johnson-Neyman间隔不适用于因子主持人。
有人可能对这个问题有任何想法吗?
请注意,它与软件包reghelper
一起很好地工作,但是这些测试我需要p值,reghelper
没有提供。
reghelper::simple_slopes(mod)
sessionInfo()
的输出是:
R版本3.6.0(2019-04-26) 平台:x86_64-pc-linux-gnu(64位)在以下环境下运行:Ubuntu 18.04.2 LTS
矩阵产品:默认BLAS:
/usr/lib/x86_64-linux-gnu/blas/libblas.so.3.7.1 LAPACK: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/lapack/liblapack.so.3.7.1语言环境:[1] LC_CTYPE = en_CA.UTF-8 LC_NUMERIC = C
LC_TIME = zh_CN.UTF-8 [4] LC_COLLATE = zh_CA.UTF-8
LC_MONETARY = zh_CA.UTF-8 LC_MESSAGES = zh_CA.UTF-8 [7] LC_PAPER = zh_CA.UTF-8 LC_NAME = C LC_ADDRESS = C
[10] LC_TELEPHONE = C LC_MEASUREMENT = zh_CA.UTF-8 LC_IDENTIFICATION = C附加的基本软件包:[1]统计图形grDevices utils
数据集方法基础通过名称空间(未附加)加载:
[1] Rcpp_1.0.1 magrittr_1.5花键_3.6.0 MASS_7.3-51.1
[5] munsell_0.5.0 colorspace_1.4-1格子_0.20-38 rlang_0.3.4
[9] minqa_1.2.4 plyr_1.8.4 tools_3.6.0 grid_3.6.0
[13] gtable_0.3.0 nlme_3.1-140 cli_1.1.0断言那个_0.2.1
[17]摘要_0.6.19 lme4_1.1-21 lazyeval_0.2.2 tibble_2.1.2
[21] crayon_1.3.4 Matrix_1.2-17 reghelper_0.3.4 nloptr_1.2.1[25] ggplot2_3.1.1互动_1.1.0 jtools_2.0.1 pander_0.6.3
[29]编译器_3.6.0支柱_1.4.1缩放_1.0.0引导_1.3-20
[33] pkgconfig_2.0.2
答案 0 :(得分:0)
(不是答案,但评论太久了。以后将酌情删除。)
在干净的R会话中,这对我有用:
data(Orthodont,package="nlme")
mod <- lme4::lmer(distance ~ age*Sex + (1|Subject), data=Orthodont)
interactions::sim_slopes(model=mod, pred=age, modx=Sex)
sessionInfo()
简单边坡分析
性别=女性时的年龄斜率:
美东时间。 S.E.吨价p
------ ------ -------- ------
0.48 0.09 5.13 0.00
性别=男性时的年龄斜率:
美东时间。 S.E.吨价p
------ ------ -------- ------
0.78 0.08 10.12 0.00
警告信息: Johnson-Neyman间隔不适用于因子主持人。
这是我的sessionInfo()
:重要内容与您的内容相同(lme4
1.1-21,interactions
1.1.0,jtools
2.0.1),但是当然不完全相同... ??
R Under development (unstable) (2019-05-21 r76566)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
Running under: Ubuntu 16.04.6 LTS
[matrix product and locale info deleted]
attached base packages:
[1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
loaded via a namespace (and not attached):
[1] Rcpp_1.0.1 magrittr_1.5 splines_3.7.0 MASS_7.3-51.4
[5] tidyselect_0.2.5 munsell_0.5.0 colorspace_1.4-1 lattice_0.20-38
[9] R6_2.4.0 rlang_0.3.4 minqa_1.2.4 plyr_1.8.4
[13] dplyr_0.8.1 tools_3.7.0 grid_3.7.0 gtable_0.3.0
[17] nlme_3.1-140 cli_1.1.0 digest_0.6.19 assertthat_0.2.1
[21] lme4_1.1-21 lazyeval_0.2.2 tibble_2.1.2 numDeriv_2016.8-1
[25] crayon_1.3.4 Matrix_1.2-17 purrr_0.3.2 nloptr_1.2.1
[29] ggplot2_3.1.1 jtools_2.0.1 interactions_1.1.0 glue_1.3.1
[33] pander_0.6.3 compiler_3.7.0 pillar_1.4.1 scales_1.0.0
[37] lmerTest_3.1-0 boot_1.3-22 pkgconfig_2.0.2
答案 1 :(得分:0)
我通过拆下lmerTest解决了这个问题。