是否可以对汇总的dcast值进行操作?

时间:2019-05-30 23:12:53

标签: r data.table dcast

dcast.data.table具有可在多个value.var上聚合的功能。是否有可能以某种方式引用正在创建的聚合值,然后在乐趣中执行操作?

这将创建4个变量

DT = data.table(x=sample(5,20,TRUE), y=sample(2,20,TRUE),
                z=sample(letters[1:2], 20,TRUE), d1 = runif(20), d2=1L)

> head(DT)
   x y z        d1 d2
1: 3 2 a 0.6166590  1
2: 3 1 a 0.1891611  1
3: 5 2 a 0.3061658  1
4: 3 1 a 0.7233832  1
5: 2 1 b 0.6799675  1
6: 2 1 b 0.5144392  1

dcast(DT, x + y ~ z, fun=sum, value.var=c("d1", "d2"))

   x y      d1_a      d1_b d2_a d2_b
1: 1 1 1.0400277 0.3835004    2    1
2: 2 1 0.7032111 1.3713884    1    2
3: 3 1 0.9759893 2.0853103    1    3
4: 3 2 0.5210792 0.0000000    1    0
5: 4 1 1.0971931 0.4417819    2    1
6: 4 2 0.5009533 0.0000000    1    0
7: 5 1 0.9372943 0.0000000    4    0
8: 5 2 0.7671728 0.0000000    1    0

然后可以在第二步中对汇总值进行运算

dcast(DT, x + y ~ z, fun=sum, value.var=c("d1", "d2"))[,.(div1 = d1_a/d2_a
                                                          ,div2 = d1_b/d2_b)]

        div1      div2
1: 0.5200139 0.3835004
2: 0.7032111 0.6856942
3: 0.9759893 0.6951034
4: 0.5210792       NaN
5: 0.5485965 0.4417819
6: 0.5009533       NaN
7: 0.2343236       NaN
8: 0.7671728       NaN

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

这有点令人费解, 但是对于这个问题,我认为您可以执行以下操作:

zs <- unique(DT$z)

sum_div <- function(dt) {
  ans <- dt[, .(div = sum(d1) / sum(d2)), by = .(z)]
  split(ans$div, factor(ans$z, levels = zs), drop = FALSE)
}

DT[, sum_div(.SD), by = .(x, y), .SDcols = c("z", "d1", "d2")]

发生的情况是,.SD最终在.SDcols中指定了3列, 但具有xy值的可能组合的不同子集。 然后,sum_div仅对该子集执行所需的操作, 和split的结果返回一个列表,以便z的每个可能值在最后的data.table中得到自己的列。

执行factor(ans$z, levels = zs)以便每次获得相同数量的列表元素很重要 (data.table期望如此); 通过指定我们期望多少levels, 如果split没有值,level将返回一个空向量, 但肯定会为每个对象返回一些东西。

请注意,您可以使用以下方法实现相同的目标:

dcast(DT[, .(div = sum(d1) / sum(d2)), by = .(x, y, z)], x + y ~ z, value.var = "div")

我不确定您一步一步完成所有操作是否会获得可观的性能。

编辑:您可能不会:

library(data.table)
library(microbenchmark)

n <- 2e5
DT = data.table(x = sample(5L, n, TRUE),
                y = sample(3L, n, TRUE),
                z = sample(letters[1:2], n, TRUE),
                d1 = runif(n),
                d2 = 1L)

zs <- sort(unique(DT$z))

sum_div <- function(dt) {
  ans <- dt[, .(div = sum(d1) / sum(d2)), by = .(z)]
  split(ans$div, factor(ans$z, levels = zs), drop = FALSE)
}

microbenchmark(
  one = DT[, sum_div(.SD), keyby = .(x, y), .SDcols = c("z", "d1", "d2")],
  two = dcast(DT[, .(div = sum(d1) / sum(d2)), by = .(x, y, z)], x + y ~ z, value.var = "div"),
  times = 10L
)
Unit: milliseconds
 expr      min       lq     mean   median       uq      max neval
  one 24.37323 25.74273 26.72413 25.99279 26.62943 34.40309    10
  two 11.31050 11.91650 12.66345 12.51094 13.01364 15.35549    10