Question

我有一个dockerized Shiny应用程序，需要从一些RDS文件中读取数据。这些RDS文件必须每月更新两次。我想用一个卷解决它，但是我的权限用户有问题。 Shiny应用程序以有光泽的用户身份运行，并且该应用程序没有对该卷目录的读取权限。我无法运行“ chown Shiny：shiny”命令，因为我失去了对主机中卷目录的权限。有什么办法可以解决这个问题？

提前谢谢！

Dockerfile

FROM rocker/shiny:3.5.3
...
COPY shiny-server.conf /etc/shiny-server/shiny-server.conf 
COPY .Renviron /srv/shiny-server 
RUN chown -R shiny:shiny /srv/shiny-server/ 
RUN cd /srv/shiny-server && git pull origin features/DTedit

shiny-server.conf

# Instruct Shiny Server to run applications as the user "shiny"
run_as shiny;

# Define a server that listens on port 3838
server {
  listen 3838;

  # Define a location at the base URL
  location / {

    # Host the directory of Shiny Apps stored in this directory
    site_dir /srv/shiny-server;

    # Log all Shiny output to files in this directory
    log_dir /var/log/shiny-server;

    # When a user visits the base URL rather than a particular application,
    # an index of the applications available in this directory will be shown.
    directory_index on;
  }
}

此article谈到了这一点，但我无法解决。

更新：最后，根据r2evans的评论，解决方案是通过chmod将755权限授予共享目录（卷）。这样，在主机端，我可以继续更新RDS文件，而在docker端，Shiny应用程序可以访问和读取文件，因为对其他人的权限为“ 5”。为了有效地刷新数据，我需要在将RDS文件覆盖到卷的目录后运行以下Docker命令：

docker exec -it container_name sh -c "cd /srv/shiny-server/ && touch /srv/shiny-server/restart.txt"

Answer 1

尝试一下，在运行容器中执行id。这将告诉您docker容器中用户的uid是什么，然后将您挂载的文件锁定为该id。让我知道它是否有效。

如何从Shiny应用程序访问Docker的卷？

1 个答案: