R

Question

我通常会编写带有多个功能的模块化脚本。当事情发展时，很难跟踪哪个函数调用（将它们命名为01-first.R 02-second.R并不总是可能的，我宁愿不使用它作为最终解决方案）。

下面是一个可能的script.R的示例，该示例将在一个助手的帮助下运行3个“主要”功能。

first <- function(...){
  # do data things
  return(first_output)
}

second <- function(first_output){
  # do data things
  # call helper
  x <- helper(...)
  # do things to x
  return(second_output)
}

third <- function(second_output){
  # do data things
  return(result)
}

我很想得到像这样的东西

这可以使用diagrammeR包在R中生成。

grViz("
digraph boxes_and_circles {

  # a 'graph' statement
  graph [overlap = true, fontsize = 10]

  # several 'node' statements
  node [shape = box,
        fontname = Helvetica]
  first; second; helper; third;

  # several 'edge' statements
  first->second second->helper 
  helper -> second
  second->third 
  third -> result
}
")

（函数调用其他函数）会很棒。真正令人敬畏的是一种根据参数显示分叉类型的方法（例如，默认情况下，first具有go_to_third=FALSE，但是如果go_to_third=TRUE会直接跳转到{{1 }}）。具有函数要处理的对象类也将很棒。

---

我已经检查了这个问题Visualizing R Function Dependencies 我想知道是否有更好的方法来做到这一点，在视觉上更好。

---

这个问题类似于MATLAB Automatically generating a diagram of function calls in MATLAB中的这个问题，我可以接受R外部使用GraphViz的破解。

Answer 1

不完全是你想要的，但我一直在研究一个库来使 dplyr 管道可视化：

https://github.com/terminological/dtrackr

它可以或多或少地做您想做的事，但在更精细的级别上。我将不胜感激，因为仍处于实验阶段。