Question

我想从多个txt文件创建一个数据帧，但是在一个数据帧中合并一个数据帧列表时遇到关键错误。

我尝试在合并之前重置数据帧的索引，但没有帮助。我在Jupyter Python 3上运行。每个txt文件都有相同的列（“ Geneid”，“ Chr”，“ Start”，“ End”，“ Strand”，“ Length”）和示例的1列（“样本1”等），最后我想在通用列（“ Geneid”，“ Chr”，“ Start”，“ End”，“ Strand”，“ Length”）上合并一个df并排列出样本1,2,3等，如果缺少值则可能用“ 0”显示

#list the files
filenames = os.listdir('path')
# Append every single file to a distinct dataframe
list_dataframes = []
for filename in filenames:
 list_dataframes.append(pd.read_table(os.path.join('path', filename)))
for dataframe in list_dataframes:
        dataframe.reset_index()
print(dataframe.columns.tolist())
#results of print: ['Geneid', 'Chr', 'Start', 'End', 'Strand', 'Length', 'sample1']
# importing functools for reduce() 
import functools
from functools import reduce
#Merge dataframes in one single df
df=reduce(lambda left, right: pd.merge(left, right, on = ['Geneid', 'Chr','Start','End','Strand','Length'], how='outer'), list_dataframes)

预期：一个单独的df，其中“示例列”根据通用列（“ Geneid”，“ Chr”，“ Start”，“ End”，“ Strand”，“ Length”）合并。

错误：KeyError：'Geneid'

合并数据框列表

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