所以我有一个字符串代表折叠RNA的二级结构，例如：
"....(((((((((...((...(((((((((((..((.(.......))))))))..))))..)))....."
我的目标是摆脱字符串极端中的这些点，以便获得：
"(((((((((...((...(((((((((((..((.(.......))))))))..))))..)))"
我一直在尝试使用gsub函数，例如：
gsub("\\.+\\(", "", string)
首先，以及：
gsub("\\)\\.+", "", string)
最后
但是此命令的输出是：
"(((((((((((((((((((((((((.......))))))))..))))..)))....."
和：
"....(((((((((...((...(((((((((((..((.(.......)))))))))))))))"
基本上，我不想删除中间的点，只希望删除开头和结尾的中间点。
有人知道用R解决它的好方法吗？
谢谢
答案 0 :(得分：8)
我们可以转义（\\.或将.放在方括号（[.]）中，因为.是可匹配任何字符的元字符。
gsub("^[.]*|[.]*$", "", string)
#[1] "(((((((((...((...(((((((((((..((.(.......))))))))..))))..)))"
在上面，我们指定锚点（^）以匹配字符串的开头，后跟零个或多个.（*）或|，零字符串末尾（$）或更多点，并替换为空白（""）
string <- "....(((((((((...((...(((((((((((..((.(.......))))))))..))))..)))....."
答案 1 :(得分：3)
在R 3.6.0中，trimws有一个whitespace=参数，因此请在末尾的注释中使用x：
trimws(x, whitespace = "\\.")
## [1] "(((((((((...((...(((((((((((..((.(.......))))))))..))))..)))"
x <- "....(((((((((...((...(((((((((((..((.(.......))))))))..))))..)))....."