标签： linux sequence analysis
我正在使用Breseq分析我的Shotgun数据。到现在为止还很简单。我在过滤数据时遇到问题。我成功滤除了基因间/非同义/无意义的突变，并且可以按频率进行过滤。现在，我想按覆盖范围对其进行过滤。但是，覆盖范围显示在所有内容的下方，而不是频率的旁边，我不想手工过滤掉所有内容。
您能告诉我一种将total_cov和ref_cov置于突变频率旁边的方法，从而使我更容易过滤掉它吗？还是您有其他建议可以使您更轻松地按覆盖率进行过滤？ 在此先感谢：）