如何在R drake中动态生成目标转换的参数?

时间:2019-05-16 05:40:05

标签: r drake-r-package

我想生成一个大型计划,其参数取决于先前计算的目标。那有可能吗?

具体来说,我需要一些类似的东西:

drake_plan(
  data = get_data(),
  lots_of_sds = get_sds_from_a_complex_pipeline()
  analysis = target(
    fun(data, mean = mean_val, sd = sd_val),
    transform = cross(mean_val = c(2, 5), sd_val = !!lots_of_sds)
  )
)

问题在于,由于尚未定义lots_of_sds,因此尝试此操作(或类似的变体)失败了,因此转换无法扩展计划。

过去有人遇到过类似情况吗?有任何想法/解决方法吗?

谢谢!我正在使用Drake 7.0.0和R版本3.5.3

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

您快到了。您需要做的就是在lots_of_sds外部预先定义drake_plan(),这是使用!!时的标准过程。

library(drake)

lots_of_sds <- c(1, 2)

drake_plan(
  data = get_data(),
  analysis = target(
    fun(data, mean = mean_val, sd = sd_val),
    transform = cross(mean_val = c(2, 5), sd_val = !!lots_of_sds)
  )
)
#> # A tibble: 5 x 2
#>   target       command                    
#>   <chr>        <expr>                     
#> 1 data         get_data()                 
#> 2 analysis_2_1 fun(data, mean = 2, sd = 1)
#> 3 analysis_5_1 fun(data, mean = 5, sd = 1)
#> 4 analysis_2_2 fun(data, mean = 2, sd = 2)
#> 5 analysis_5_2 fun(data, mean = 5, sd = 2)

reprex package(v0.2.1)于2019-05-16创建

在运行lots_of_sdsdrake_plan()之前,make()的值必须已经存在。 drake的这一局限性将难以克服:https://github.com/ropensci/drake/issues/685