如何用R中的30个fasta文件创建一个SQLite数据库?

时间:2019-05-13 12:10:42

标签: r sqlite fasta

我想用“ DECIPHER” R包装对30个多个基因组的同源区域进行比对。我有30种fasta格式的序列,但是程序包的功能需要带有基因组的sqlite数据库。

我尝试使用RSQLite的函数dbWriteTable和出现在“ sqldf”包中的函数,但它们似乎只允许使用csv文件。

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