Question

我试图将文件从一个目录（在下面定义为$ inDir）复制到另一个目录（在下面定义为$ outDir），如果它们1）存在并且2）文件中有多于1行（这是为了避免复制）文件为空文本文件）。我能够使用下面的代码来完成第一部分，但正努力了解如何完成后一部分。我在以某种方式要求使用awk和NR，但是我对用Bash编码不是很好，因此任何帮助将不胜感激。我希望将其合并到下面，以便可以一步完成。

for i in $inDir/NVDI_500m_mean_distance_*_40PCs; do
    batch_name_dir=$i;
    batch_name=$(basename $i);
    if [ ! -f $outDir/${batch_name}.plink.gz ]; then
            echo 'Copying' $batch_name;
            find $batch_name_dir -name ${batch_name}.plink.gz -exec cp {} $outDir/${batch_name}.plink.gz \;
    else
            echo $batch_name 'already exists'
    fi
done

Answer 1

您可以使用wc -l来检查文件中有多少行，而awk可以仅从结果中删除数字。

lines=$(wc -l $YOUR_FILE_NAME | awk '{print $1}')

if [ $lines -gt 0 ]; then 
    //copy the file 
fi

编辑：我已根据以下评论将LINES纠正为行。

Answer 2

我建议这样做：

for f in "$(find $indir -type f -name 'NVDI_500m_mean_distance_*_40PC' -not -empty)"; 
do 
  cp "$f" /some/targetdir; 
done

find的速度比wc更快，可以检查零大小。

主观上，我认为它比其他解决方案更具可读性。

但是，由于以下原因，不需要for循环

find "$indir" -type f -name 'NVDI_500m_mean_distance_*_40PC' -not -empty |\
    xargs -I % cp % /some/targetdir/%

总是“引用”路径字符串，因为大多数shell utils在字符串中存在未转义的shell字符或空格时会中断。很少有没有理由使用无引号的字符串。

如何在Bash中复制多于1行的文件

2 个答案: