我正在使用80个乘法推算数据集和软件包mitml
来估计多级模型。我可以使用testModels()
命令比较嵌套模型,但是我想查看80个独立插补模型中每个模型的模型拟合分量(特别是偏差),并计算总体平均偏差值。
我的模型估算值保存在名为mitml.result
的{{1}}列表中。
我可以使用索引提取第一个模型(共80个)的偏差值:
modelt1
但是,我不确定如何有效地提取和平均所有这些值的80。我知道我需要使用循环,但是我不确定如何将循环与这样的索引结合起来。
我的尝试是这样的:
> modelt1[[1]]@devcomp[["cmp"]][["dev"]]
[1] 22637.1
毫不奇怪,这仅返回> for(i in modelt1){print(modelt1[[1]]@devcomp[["cmp"]][["dev"]])}
[1] 22637.1
中第一个模型的偏差。
我尝试将modelt1
替换为[[1]]
,但出现错误。
我还试图遍历所有这样的模型:
[[i]]
但是,当我只需要偏差值时,当然可以为所有80个模型提供完整的摘要输出。
如何编写一个循环,将打印所有80个偏差值?
答案 0 :(得分:2)
你很近。诀窍是使用序列i in 1:length(fit)
。只是i in fit
仅产生一个值,这就是为什么只有一个系数的原因。
for (i in 1:length(fit)) print(fit[[i]]@devcomp[["cmp"]][["dev"]])
# [1] 8874.517
# [1] 8874.517
# [1] 8874.517
# [1] 8874.517
# [1] 8874.517
但是,由于R是向量化语言,出于速度和便利性的原因,我建议(在大多数情况下)建议不要使用for
循环,而应该习惯sapply
& Co.。
示例:
library(mitml)
fml <- ReadDis + SES ~ ReadAchiev + (1|ID)
imp <- panImpute(studentratings, formula=fml, n.burn=1000, n.iter=100, m=5)
implist <- mitmlComplete(imp, print=1:5)
library(lme4)
fit <- with(implist, lmer(ReadAchiev ~ (1|ID), REML=FALSE))
sapply(seq(fit), function(i) fit[[i]]@devcomp[["cmp"]][["dev"]])
# [1] 8874.517 8874.517 8874.517 8874.517 8874.517