如何从python的.CEL文件中提取数据表？

Question

我有一个从www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/GDSbrowser下载的.CEL文件。需要从文件中提取数据的numpy数组。我从Bio.Affy库中导入了CelFile：

with open('Myfile.CEL') as f:
    c = CelFile.read(f)
    print(c)

这不显示任何数据集！关于如何使用CelFile的任何想法？谢谢。

Answer 1

read（）方法返回一个记录对象（在您的示例中为c）。该对象具有多个数组，例如强度，stdev，npix等，您需要这些。

在这里找到一些使用它的示例：

https://biopython.org/DIST/docs/api/Bio.Affy.CelFile.Record-class.html

有时help（）函数可以为您提供有关如何使用类，函数等的足够信息。