Question

我有一个.h5 file，可以用Matlab，IDL和python读取。但是，Matlab和python都加载了此文件，但是数据集获得了数据类型H5T_STD_U16LE (uint16)。基本上，我有浮点值，这些值会在读取过程中转换为整数，使0.1之类的值变成0。

使用IDL进行读取会忽略HDF5文件中的内部标志，并为我提供适当的值。

在Matlab或python中是否有一种方法可以以双精度强制读取HDF5文件数据集？

在Matlab中，我这样做：

hinfo = hdf5info('./data.h5');
dset = hdf5read(hinfo.GroupHierarchy.Groups(1).Groups(1).Datasets(1));

在python中：

import h5py
f = h5py.File('./data.h5', 'r')
dset = f['entry']['data']['data']

Answer 1

重新解释Numpy中的数据

首先，请确保您知道实际的数据类型。您编写了float，但是必须知道确切的数据类型（float64，float32，float16）和顺序（Little，BigEndian）。

将float64解释为uint16并返回

import numpy as np
#copy the dset using np.copy()
#The following should be quite straight forward
A=np.ones(2)
print(A)
#Interpret the data as np.uint16
B=np.frombuffer(A,dtype=np.uint16)
print(B)
#Make the reverse
C=np.frombuffer(B,dtype=np.float64)
print(C)

[1. 1.]
[    0     0     0 16368     0     0     0 16368]
[1. 1.]

如何加载具有错误数据类型标志的HDF5文件？

1 个答案:

重新解释Numpy中的数据