SRAdb软件包中的getSRAfile函数错误

时间:2019-05-02 13:54:12

标签: r bioinformatics ncbi rna-seq

我正在尝试使用SRAdb package从NCBI SRA存储库下载RNASeq数据。我始终收到以下错误:

getSRAfile( in_acc = c("SRR2033366", "SRR2033446"), 
  sra_con = sra_con,
  destDir = getwd(), 
  fileType = 'sra', 
  srcType = 'ftp', 
  makeDirectory = FALSE,
  method = 'curl',
  ascpCMD = NULL)

Error in if (is.na(sra_acc$run[i])) { : argument is of length zero

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