在ubuntu中安装R包

时间:2011-04-08 12:41:00

标签: r r-package

这里有一些新手。我一直在R for Windows工作,最近搬到了ubuntu,(我认为是“Hardy Heron”)。我也不是一个Linux家伙。无论如何。我想安装“diptest”包。我运行了命令

install.packages("diptest") 

,输出为:

  

将软件包安装到'/home/smart/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.6'       (因为'lib'未指定)   因为我正在运行R 2.12.1,这有点奇怪。然后它就会挂起。

另外,如果我打电话给library("diptest"),它说我需要重新安装包,因为它是为R 2.6构建的。重新安装的过程是否与install.packages不同?谢谢。很抱歉问这么简单的问题。

1 个答案:

答案 0 :(得分:11)

重新安装与安装完全相同,即install.packages(“diptest”)。您可能希望使用选项repos指向正确的存储库。似乎出现了问题。 AFAIK R使用正确的版本,但是你的安装可能会出现奇怪的现象。请务必遵循在debian here上安装R的说明。

因此,我的回购将会:

install.packages("diptest",
   repos="http://www.freestatistics.org/cran/bin/windows/contrib/2.12")

您可以使用命令packageStatus()获取一些信息。这也应该为您提供存储库,例如:

> update(packageStatus())
Number of installed packages:

                         ok upgrade unavailable
  E:/R/Library          111       1           2
  C:/R/R-2.12.2/library  26       2           0

Number of available packages (each package counted only once):

                                                              installed not installed
  http://www.freestatistics.org/cran/bin/windows/contrib/2.12        99          2791
  http://www.stats.ox.ac.uk/pub/RWin/bin/windows/contrib/2.12         3            12

如果可以,您可以检查包是否实际安装:

"diptest" %in% installed.packages()

如果是,您可以查看old.packages()是否可以找到更新的版本。

> old.packages()
         Package    LibPath                 Installed     Built    ReposVer     
survival "survival" "E:/R/Library"          "2.36-2"      "2.12.1" "2.36-5"     
lattice  "lattice"  "C:/R/R-2.12.2/library" "0.19-17"     "2.12.2" "0.19-23"    
Matrix   "Matrix"   "C:/R/R-2.12.2/library" "0.999375-46" "2.12.2" "0.999375-49"
         Repository                                                   
survival "http://www.freestatistics.org/cran/bin/windows/contrib/2.12"
lattice  "http://www.freestatistics.org/cran/bin/windows/contrib/2.12"
Matrix   "http://www.freestatistics.org/cran/bin/windows/contrib/2.12"

如果是这样,您可以使用

安装新版本

install.packages("diptest")

或只是使用

更新所有这些内容
update.packages()

HTH