Question

我正在尝试使用MySQL pkg尝试获取多个查询的结果，所以我编写了一个循环：

db = connect_db()

variants_location = get_data_from_variant_file(variant_file)

query = MySQL.Stmt(db, """SELECT info
                          FROM hgmd_hg38_vcf
                          WHERE chrom = (?) AND pos = (?) AND ref = (?) AND alt = (?);""")

for loc in variants_location
    println(MySQL.execute!(query, loc))
end

以下是“ variants_location”变量的一个元素： SubString{String}["16", "2074320", "C", "A"]

有没有一种方法可以获取查询的执行结果？我尝试只打印它，但是它只返回一个数字。

Answer 1

根据文档，MySQL.jl似乎不支持用于选择数据的预编译SQL查询（只能使用INSERT，DELETE，UPDATE ）

您有以下选择：

构建sql字符串，并使用上面建议的MySQL.Query(conn, sql) |> DataFrame模式。但是，这易于进行SQL注入，并且需要每次由数据库编译查询。
使用INSERT将结果存储在临时表中，而不是使用上述模式获取结果-这有点难看
通过PyCall.jl或JDBC.jl库使用Python或Java驱动程序。这需要更多的配置，但是Python和Java MySQL驱动程序都支持预编译的语句。

如何使SQL查询循环？

1 个答案: