在Jupyter笔记本中直接在R中绘制临床研究对象流程图

Question

我正在Jupyter中使用R（3.x）进行临床研究的一些统计分析。

受试者的流程非常复杂，我想直接在笔记本上绘制“患者”流程图。像这样一个：

为什么？ 为了确保主题计数与代码一致，并且不必在R代码与该图形之间保持同步。

我已经尝试过DiagrammeR（由于某种原因无法安装），RGahpviz（太复杂且不符合要求）。

mermaid可能是一个完美的解决方案，但是我找不到将其与Jupyter / R笔记本集成的方法。

我不是使用python笔记本，而是使用R笔记本。

Answer 1

您已经提到过将不会安装DiagrammeR，但是无论如何我仍然会提供一个使用DiagrammeR的解决方案，以防您解决了安装问题。假设在使用DimagrammeR制作图形并获得名为myGraph的grViz对象之后。要将其显示在jupyter笔记本下，我使用以下

require('DiagrammeR')
require('DiagrammeRsvg') #export grViz objects to svg
require('IRdisplay')
mySVG<-export_svg(myGraph)
display_svg(data=mySVG)