需要将名称与逗号分隔列表匹配的函数

时间:2019-04-18 21:38:37

标签: r substring match

我有一个长度为2139的SNP名称列表。 我一直试图一次将这些名称中的每一个与该23行的字符列表进行匹配,其中每行包含多个名称,因此
我可以为每个SNP分配基因座名称。

我尝试过grep并匹配,但没有任何效果。这显示了我的字符向量的前10个具有SNP名称的元素:

   [1] kgp32557    kgp37275    kgp38994    kgp45973    kgp53783      kgp61605    kgp73110    kgp74757   

这显示了23行的字符列表(也被截断了
因为每行中有很多名称,所以我在第1行中显示了一个名称列表:

    [1,]   kgp9852430,rs1017860,rs7242868,kgp7009716,kgp6611434,kgp4808508,rs2850724,kgp3871878,kgp16151703,kgp16188651,rs9954562,kgp16153963,kgp7895020,....

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