Question

我正试图在带有Corei7处理器的iMac上使用OpenMPI从MIT构建meep。我使用macport安装了OpenMPI。

我还用OpenMPI安装了hdf5。

现在当我尝试使用--with-mpi使用mpi编译meep时，meep不会编译并提供以下错误消息。

CXXLD  meep_mpi
Undefined symbols:
  "MPI::Comm::Set_errhandler(MPI::Errhandler const&)", referenced from:
  vtable for MPI::Intercommin libmeep_mpi.a(h5file.o)
  vtable for MPI::Graphcommin libmeep_mpi.a(h5file.o)
  vtable for MPI::Cartcommin libmeep_mpi.a(h5file.o)
  vtable for MPI::Intracommin libmeep_mpi.a(h5file.o)
  vtable for MPI::Commin libmeep_mpi.a(h5file.o)
  vtable for MPI::Intercommin libmeep_mpi.a(mympi.o)
  vtable for MPI::Graphcommin libmeep_mpi.a(mympi.o)
  vtable for MPI::Cartcommin libmeep_mpi.a(mympi.o)
  vtable for MPI::Intracommin libmeep_mpi.a(mympi.o)
  vtable for MPI::Commin libmeep_mpi.a(mympi.o)
  "MPI::Win::Set_errhandler(MPI::Errhandler const&)", referenced from:
  vtable for MPI::Winin libmeep_mpi.a(h5file.o)
  vtable for MPI::Winin libmeep_mpi.a(mympi.o)
ld: symbol(s) not found
collect2: ld returned 1 exit status
make[3]: *** [meep_mpi] Error 1
make[2]: *** [all] Error 2
make[1]: *** [all-recursive] Error 1
make: *** [all] Error 2

我不明白哪里出错了。我按照meep网站上的说明进行操作。 Parallel Meep和Meep Installation

请帮忙。

Answer 1

我推荐mpich与openmpi（我的偏好），但请确保您的HDF5 MPI安装正常（即，确保设置--with-mpi配置标志并检查您的配置是否已找到您的mpi安装运行configure后的最终消息。

Answer 2

有同样的问题。如果你将openmpi二进制文件链接到mpixxx等价物（如openmpicc - ＆gt; mpicc），它就可以工作。否则配置脚本正在查找它们但无法找到它们并丢弃--with-mpi标志。

使用openmpi编译meep

2 个答案: