如何在jupyter-notebook中安装R-magic？

Question

我在jupyter中创建了一个名为“ rpy2”的新环境，并尝试使用%%R魔术，但安装失败。

QN：如何在jupyter-notebook中使用%% R魔法？

平台：MacOS High Sierra

步骤

jupyter kernelspec list
conda create -n rpy2 python=3.7
source activate rpy2
which pip
/Users/poudel/miniconda3/envs/rpy2/bin/pip install rpy2
conda install ipykernel
python -m ipykernel install --user --name rpy2 --display-name "Py37rpy2"
jupyter-notebook

问题

# Now 
import rpy2 shows no error
import rpy2.rinterface  # gives error

注意

# I have checked all the files given in error log, all of them exist
  492  ls /Users/poudel/miniconda3/lib/R/lib/libR.dylib
  493  ls /usr/lib/libiconv.2.dylib
  494  ls /Users/poudel/miniconda3/lib/R/lib/libR.dylib
  495  /Users/poudel/miniconda3/lib/R/lib/libR.dylib
  496  ls /Users/poudel/miniconda3/lib/R/lib/libR.dylib

All shows given file, and none is missing.

错误

OSError：无法加载库'/Users/poudel/miniconda3/lib/R/lib/libR.dylib'：dlopen（/Users/poudel/miniconda3/lib/R/lib/libR.dylib，2）：符号找不到：_libiconv       引用自：/Users/poudel/miniconda3/lib/R/lib/libR.dylib       预期位于：/usr/lib/libiconv.2.dylib      在/Users/poudel/miniconda3/lib/R/lib/libR.dylib

更新 正如@akrun所建议的那样，我尝试使用pyper，但是加载一个库需要花费无限的时间，并且在停止时表明它已损坏管道。

pip install pyper。

Answer 1

如果您仍在寻找解决方案，这就是您所需要的。

用

启动笔记本 <块引用>

%load_ext rpy2.ipython

然后使用 R 魔法函数运行 R 单元

<块引用>

%%R

图书馆（“tidyverse”）

这适用于最新的 rpy2 版本 (3.4.5)。