写入SQL数据库时发生I / O错误

时间:2019-04-13 00:27:59

标签: python sql sqlite io

我有一个要向其中插入行并填充值的数据库。我目前在Python 3上使用sqlite3。令我惊讶的是,如果我只是一次手动插入行/值(例如iterations = 1),那么它将起作用。此外,如果我将iterations保持在(大约)100以下(大约),它将同样有效!但是,随着我增加迭代次数,由于某些原因,我可能无法超过某些随机变化的迭代次数(通常在1000以下),并且每次都观察到以下错误。

是什么导致此错误?如何克服它,以便我可以使iterations尽可能大(例如1000000)?以下是较大代码中的一个简短摘要:


column1 = 'id'
column2 = 'shot'
column3 = 'time'
column4 = 'psi'
column5 = 'temp'
column6 = 'dens'
column7 = 'temp_err'
column8 = 'dens_err'
iterations = 1000
timeout = 100
i = 0 
while i < iterations:
    try:  
        time = 3
        psi = 2 
        unique_id = 232
        temp = 0.4
        dens = 0.2
        temp_err = 0.02
        dens_err = 0.01
        values = [str(unique_id),str(shot),time,psi,temp,dens,temp_err,dens_err]
        conn = sqlite3.connect(sqlite_file,timeout=timeout)
        cursor = conn.cursor()
        cursor.execute("INSERT INTO {tn} ({c1},{c2},{c3},{c4},{c5},{c6},{c7},{c8}) VALUES ({o1},{o2},{o3},{o4},{o5},{o6},{o7},{o8})".\
                    format(tn=table_name,c1=column1,c2=column2,c3=column3,c4=column4,c5=column5,c6=column6,c7=column7,c8=column8,o1=values[0],\
                           o2=values[1],o3=values[2],o4=values[3],o5=values[4],o6=values[5],o7=values[6],o8=values[7]))
        conn.commit() 
        conn.close() 
    except sqlite3.IntegrityError:
        print('ERROR: ID already exists in PRIMARY KEY column {}'.format(column1)) 
    i = i + 1    

我观察到的错误是:

Traceback (most recent call last):

  File "<ipython-input-27-59d2691987a1>", line 18, in <module>
    o2=values[1],o3=values[2],o4=values[3],o5=values[4],o6=values[5],o7=values[6],o8=values[7]))

OperationalError: disk I/O error

我尝试增加timeout并在循环外连接/提交/关闭与数据库的连接,但是这些方法无效。


另一个对我有用的解决方案:

column1 = 'id'
column2 = 'shot'
column3 = 'time'
column4 = 'psi'
column5 = 'temp'
column6 = 'dens'
column7 = 'temp_err'
column8 = 'dens_err'
iterations = 10000
timeout = 100 
with sqlite3.connect(sqlite_file,timeout=timeout) as conn:
    cursor = conn.cursor()
    i = 0 
    while i < iterations:
        try:  
            time = 3
            psi = 2 
            unique_id = 232
            temp = 0.4
            dens = 0.2
            temp_err = 0.02
            dens_err = 0.01
            values = [str(unique_id),str(shot),time,psi,temp,dens,temp_err,dens_err]
            cursor.execute("INSERT INTO {tn} ({c1},{c2},{c3},{c4},{c5},{c6},{c7},{c8}) VALUES ({o1},{o2},{o3},{o4},{o5},{o6},{o7},{o8})".\
                        format(tn=table_name,c1=column1,c2=column2,c3=column3,c4=column4,c5=column5,c6=column6,c7=column7,c8=column8,o1=values[0],\
                               o2=values[1],o3=values[2],o4=values[3],o5=values[4],o6=values[5],o7=values[6],o8=values[7]))
        except sqlite3.IntegrityError:
            print('ERROR: ID already exists in PRIMARY KEY column {}'.format(column1)) 
        i = i + 1  
        print(i)
    conn.commit()  

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

如何在驱动器上设置数据库?驱动器可能已满,无法再写入,或者系统无法处理吞吐量。

检查sqlite3使用的驱动器是否已满,如果没有,请尝试在两次插入之间添加短暂的延迟。另外,您可以尝试预先计算要插入的所有数据,然后运行一个大批量插入而不是多个小批量插入。

它不应该与您的Python代码有关,而与sqlite3 /硬件方面有关。

修改

根据@Jonathan Willcock的评论,您还可以尝试将所有插入内容包装到一个事务中。

要执行此操作,您将不得不重新整理一些内容。该流应该是这样的:

open connection > start transaction > run queries > commit transaction on success / rollback transaction on error > close connection

try:
    conn = sqlite3.connect(sqlite_file, timeout=timeout, isolation_level=None)
    cursor = conn.cursor()
    while i < iterations:
        # your loop here
    conn.commit()
except sqlite3.IntegrityError:
    conn.rollback()
    # other error handling here
finally:
    conn.close()