Question

我刚开始使用Ubuntu并希望在R中编程。我从终端成功安装了最新版本的R（目前为2.12.2）。然后我尝试运行以下命令：

> install.packages("XML")
Installing package(s) into ‘/usr/local/lib/R/site-library’
(as ‘lib’ is unspecified)
Warning in install.packages("XML") :
  'lib = "/usr/local/lib/R/site-library"' is not writable
Would you like to create a personal library
'~/R/i686-pc-linux-gnu-library/2.12'
to install packages into?  (y/n)

我应该创建个人目录还是错过了允许我写入站点库的某个步骤。

提前致谢。

Answer 1

sarnold的评论非常正确。在Debian（以及Ubuntu）包中，目录/usr/local/lib/R/site-library/由文件/var/lib/dpkg/info/r-base-core.postinst脚本创建 - 相关代码为：

# edd 03 Apr 2003  cf Section 10.1.2 of Debian Policy
if [ ! -e /usr/local/lib/R ]; then
  if mkdir /usr/local/lib/R 2>/dev/null; then
    chown root:staff /usr/local/lib/R
    chmod 2775 /usr/local/lib/R
  fi
fi
if [ ! -e /usr/local/lib/R/site-library ]; then
  if mkdir /usr/local/lib/R/site-library 2>/dev/null; then
    chown root:staff /usr/local/lib/R/site-library
    chmod 2775 /usr/local/lib/R/site-library
  fi
fi

因此目录由root:staff和模式2775拥有，或者'用户和组读写，其他只读'。

所以要写在那里，你有两个基本选择：

始终使用sudo或成为笨拙的root。
将您自己添加到论坛staff。它可能有一个用户友好的GUI;我是Unix老派，通过编辑/etc/group和/etc/gshadow手动完成 - 之后你可以直接安装（你需要一个新的shell来拥有这些权利，或者只是启动一个新的终端）。您当然也可以选择一个不同的组，或者创建一个组，但是您还需要相应地更改/usr/local/lib/R/中的目录树。

希望这会有所帮助。 r-sig-debian列表是这样的Debian / Ubuntu问题的友好地方，我推荐它。之前出现了这个问题。

编辑：此外，相当多（更复杂）的软件包是Ubuntu / Debian的一部分，因此要获得XML，您只需sudo apt-get install r-cran-xml即可。执行apt-cache search r-cran查看可用内容。

Answer 2

最简单的选择是将自己添加到staff用户组。跑吧：

sudo adduser <user> staff

将<user>替换为您的用户名。

在Ubuntu 14.04中测试

在Debian / Ubuntu中安装R Package XML

2 个答案: